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Mikrobielle Expressionssysteme, wie Bakterien (Escherichia coli) und Hefe (Hansenula polymorpha, Pichia pastoris, Saccharomyces cerevisiae) sind in der biopharmazeutischen Industrie weit verbreitet. Neben Impfstoff, Peptid, Enzym, Nano-Antikörper, Antikörperfragment, Wachstumsfaktor, Zytokin, Antigen und Kollagen können auch die folgenden Proteine in mikrobiellen Zellen produziert werden.

Typen/Familie	Proteine	Anwendung
Albumin	Humanserumalbumin (HSA)	Als Wirkstoff bei niedrigem Albuminspiegel oder als inaktiver Bestandteil
	Katzenserumalbumin (FSA)	Anstieg des Albuminspiegels und des osmotischen Drucks
	Hundeserumalbumin (CSA)	Anstieg des Albuminspiegels und des osmotischen Drucks
	Rinderserumalbumin (BSA)	Als Standardreagenz in Experimenten
Chemokin	Von Stromazellen abgeleiteter Faktor 1 (SDF-1)	Schutz des Herzens vor Ischämie-Reperfusionsschäden; Stimulierung der Herzangiogenese
Heparin-bindender Wachstumsfaktor	Midkine	Ausübung von Aktivitäten wie Angiogenese und Fibrinolyse.
Osteoblastenfaktor	MEPE-Fragment	Fördert die Knochenbildung und Osteoblastenproliferation
Apolipoprotein	Clusterin (CLU), Apolipoprotein A	Beseitigung von Zelltrümmern und Apoptose
E3-Ubiquitin-Ligase	Parkin-Protein	Verbesserung der Parkinson-Symptome
Annexin	Anhangin 5	Hemmung von Entzündungen und Endothelaktivierung als potenzielles Therapeutikum bei Sepsis
Neurotoxische Peptide	Conopeptide, Conotoxine	Zur Schmerzbehandlung und für kosmetische Zwecke (z. B. gegen Falten)
Neurotoxische Peptide	Botulinumtoxin
Fusionsprotein	Mit Humanserumalbumin (HSA) fusionierte Proteine	Verbesserung der pharmakokinetischen Eigenschaften und Verlängerung der Halbwertszeit von Peptiden oder Proteinen (hauptsächlich als Träger zur Verlängerung der Halbwertszeit)
	Entwickelte Ankyrin-Repeat-Proteine (DARPins), wie DARPins, die HSA-bindende Domänen enthalten
	Andere Fusionsproteine	Maßgeschneidertes Protein

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