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RNA trans-autoricostituente (taRNA)

RNA trans-autoricostituente (taRNA)

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RNA trans-autoricostituente (taRNA)

Come per gli mRNA non amplificabili, lo sa-RNA è composto da un cappio 5', un UTR 5', una regione ORF (frame di lettura aperto), un UTR 3' e una coda poly(A) 3'. Tuttavia, lo saRNA differisce molto dagli mRNA non amplificanti in quanto contiene la sequenza codificante della replicasi a valle dell'UTR 5'. Con sequenze codificanti superiori a 7000 nucleotidi, le proteine virali sono altamente immunogeniche, il che limita la dimensione dell'antigene in tali vaccini.

Il taRNA è un tipo di saRNA in cui la sequenza virale, i nsPs e il gene di interesse (GOI) sono coinvolti in diversi mRNA ma funzionano insieme. Pirjo Spuul et al. hanno introdotto per la prima volta il concetto di un sistema di replicazione trans nel 2011.

La replicasi virale può essere nrRNA o saRNA, e gli mRNA che codificano i GOI vengono chiamati trans-repliconi (TR-RNA). Per amplificare il TR-RNA, elementi di sequenza conservati (5'CSE e 3'CSE) provenienti dall'alfaviridae fiancheggiano il GOI, con il promotore subgenomico dell'alfaviridae posizionato a monte del GOI. La progettazione del taRNA tiene in considerazione i vantaggi degli saRNA e allevia alcune delle loro svantaggi. In particolare, le replicasi autonome codificate su una piattaforma RNA evitano le limitazioni della lunghezza dei GOI e non vincolano l'uso di nucleotidi modificati.

Ulteriori progressi nella tecnologia taRNA hanno portato allo sviluppo di un taRNA migliorato con una regione ricca di adenina nel 5' UTR. Questo taRNA revisionato, privo del promotore subgenomico degli alfaviridi, risulta in un RNA più corto e in una riduzione dieci volte maggiore del dosaggio del vaccino, senza influire sui livelli di espressione in vitro.

In generale, la tecnologia taRNA è ancora agli albori, ma le sue applicazioni pratiche sono promettenti. Studi preclinici sui vaccini taRNA contro i virus dell'influenza sono attualmente in corso. Vaccini bivalenti contro il virus della chikungunya e del fiume Ross stanno anche essere sviluppati in questo modo.

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