Comme les ARNm non amplifiables, l'ARNsa se compose d'une coiffe 5', d'un UTR 5', d'une région ORF (cadre de lecture ouvert), d'un UTR 3' et d'une queue poly(A) 3'. Tandis que le saRNA est très différent de l'ARNm non amplificateur en ce sens qu'il contient la séquence codante pour la réplicase en aval du 5'UTR. Avec des séquences codantes dépassant 7000 XNUMX nucléotides, les protéines virales sont hautement immunogènes, limitant ainsi la taille de l'antigène dans ces vaccins.
Le TaRNA est un type de saRNA dans lequel la séquence virale, les nsP et le gène d’intérêt (GOI) sont impliqués dans différents ARNm mais fonctionnent ensemble. Pirjo Spuul et coll. a introduit le concept d'un système de trans-réplication pour la première fois en 2011.
La réplicase virale peut être un ARNnr ou un ARNsa, et les ARNm codant pour les GOI sont appelés trans-réplicons (TR-ARN). Pour réaliser l'amplification du TR-ARN, les éléments de séquence conservés (5'CSE et 3'CSE) proviennent de l'alphavirus encadrant le GOI, avec le SGP de l'alphavirus en amont du GOI. La conception des taRNA prend en compte les avantages des saRNA et atténue certains de leurs inconvénients. En particulier, les réplicases autonomes codant dans une plate-forme d'ARN évitent les limitations de longueur des GOI et ne limitent pas l'utilisation de nucléotides modifiés.
Further advances in taRNA technology have resulted in the development of an improved taRNA with an adenine-rich region in the 5' UTR. This revised taRNA’s lacking the subgenomic promoter of alphaviruses results in a shorter RNA and a 10-fold decrease in vaccine dose, without affecting in vitro expression levels.
Overall, taRNA technology is still in its infancy, but its practical applications are promising. Preclinical studies of taRNA vaccines against influenza viruses are currently underway. Bivalent vaccines against chikungunya and Ross River viruses are also under development in this way.
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