Analyse |
Méthodologie |
Masse moléculaire |
Chromatographie Liquide-Spectrométrie de Masse (LC-MS) / Chromatographie Liquide/Spectrométrie de Masse par Electrospray (LC/ES-MS) de protéines intactes, réduites et N-déglycosylées |
Analyse des variantes de taille |
LC-MS, chromatographie d'exclusion de taille-spectrométrie de masse (SEC-MS), diffusion dynamique de la lumière (DLS), ultracentrifugation analytique (AUC), chromatographie d'exclusion de taille-diffusion de la lumière multi-angle (SEC-MALS) |
Analyse des variantes de charge |
LC-MS, chromatographie par échange d'ions-spectrométrie de masse (IEX-MS) |
Stabilité thermique (Tm) |
Calorimètre différentiel à balayage (DSC) |
Coefficient d'extinction |
Analyseurs d'acides aminés |
Cartographie peptidique |
LC-MS après digestion par protéase |
Couverture des séquences de protéines |
LC-MS après une à trois digestions |
Séquençage N-terminal |
LC-MS après digestion, déterminée par cartographie peptidiqueDégradation d'Edman |
Séquençage du terminal C |
LC-MS après digestion |
Liaisons disulfure |
LC-MS après digestion |
Groupes sulfhydryle libres |
Test d'Ellman |
Oxydation des acides aminés |
LC-MS, chromatographie liquide haute performance en phase inverse (RP-HPLC) ou chromatographie par interaction hydrophobe-chromatographie liquide haute performance (HIC-HPLC) et spectrométrie de masse (MS) |
Isomérisation des acides aminés |
LC-MS après clivage enzymatique |
Désamidation |
LC-MS après clivage enzymatique |
Modification du terminal N |
LC-MS après digestion |
Modification du terminal C |
LC-MS après digestion |
Coupure de lysine C-terminale |
LC-MS après digestion |
Profilage des N-glycanes |
LC-MS des glycanes libérés |
Site de N-glycosylation |
LC-MS après clivage enzymatique |
Occupation du site de N-glycosylation |
LC-MS après digestion par déglycosylase et protéase (trypsine ou Asp-N) |
Structure d'ordre supérieur |
Dichroïsme circulaire (CD)Spectromètre infrarouge (IR) |