Подобно неамплифицируемым мРНК, sa-РНК состоит из 5'-кэпа, 5'-UTR, области ORF (открытой рамки считывания), 3'-UTR и 3'-поли(A)-хвоста. В то время как saRNA сильно отличается от неамплифицирующейся мРНК тем, что она содержит последовательность, кодирующую репликазу, расположенную ниже 5'UTR. Поскольку кодирующие последовательности превышают 7000 нуклеотидов, вирусные белки обладают высокой иммуногенностью, что ограничивает размер антигена в таких вакцинах.
TaRNA представляет собой тип saRNA, в котором вирусная последовательность, nsP и интересующий ген (GOI) участвуют в разных мРНК, но функционируют вместе. Пирьо Спуул и др. впервые представил концепцию трансрепликационной системы в 2011 году.
Вирусная репликаза может представлять собой нрРНК или saРНК, а мРНК, кодирующие GOI, называются транс-репликонами (TR-РНК). Для амплификации TR-РНК элементы консервативной последовательности (5'CSE и 3'CSE) берутся из альфавируса, фланкирующего ГОИ, с SGP альфавируса, расположенного выше ГОИ. Дизайн таРНК учитывает преимущества saРНК и смягчает некоторые их недостатки. В частности, автономные репликазы, кодирующие на платформе РНК, позволяют избежать ограничений длины GOI и не ограничивают использование модифицированных нуклеотидов.
Дальнейшие достижения в технологии таРНК привели к разработке улучшенной таРНК с богатой аденином областью в 5'-UTR. Отсутствие в этой пересмотренной таРНК субгеномного промотора альфавирусов приводит к укорочению РНК и 10-кратному снижению дозы вакцины, не влияя при этом на уровни экспрессии in vitro.
В целом технология таРНК все еще находится в зачаточном состоянии, но ее практическое применение многообещающе. В настоящее время проводятся доклинические исследования вакцин taRNA против вирусов гриппа. Таким же образом разрабатываются бивалентные вакцины против вирусов чикунгунья и Росс-Ривер.
Био-фармацевтическое универсальное решение CRDMO от Yaohai для длиннокодирующей РНК