Самоамплифицирующаяся мРНК (саРНК), также известная как репликонная РНК, кодирует последовательности мРНК транскрипции in vitro (IVT) и гены вирусной репликазы, полученные из альфавирусов или флавивирусов. Гены вирусных репликаз позволяют самоамплифицировать мРНК, что приводит к увеличению экспрессии белка и минимально необходимой дозе РНК по сравнению с неамплифицирующими мРНК. Другой аспект заключается в том, что saRNA представляет собой относительно большую молекулу (более 14 т.п.н.).
Компания Yaohai Bio-Pharma разработала набор технологий синтеза мРНК для получения неамплифицирующейся мРНК и самоамплифицирующейся мРНК (1000 нт~14000 нт), таких как разработка и оптимизация последовательностей, IVT, очистка, лиофилизация и инкапсуляция липидных наночастиц (LNP). . Вся продукция выпускается под строгими стандартами контроля качества.
Рис.1. Структурные особенности мРНК IVT: обычная, кольцевая и самоамплифицирующаяся мРНК.
Самоамплифицирующаяся РНК состоит из четырех неструктурных белков (обозначенных как nsP1, nsP2, nsP3 и nsP4), которые происходят из альфавирусов вируса венесуэльского лошадиного энцефалита (VEEV). Среди них nsP1 проявляет двойную ферментативную активность, а именно GTase и N7MTase, тогда как nsP2 обладает активностью RTPase, имеющей решающее значение для кэпирования мРНК IVT с образованием структуры Cap 0. Кроме того, nsP2 выполняет функцию протеазы и геликазы, облегчая сложный процессинг всего комплекса nsP. Точная функция nsP3 остается неясной, однако он взаимодействует с различными белками клетки-хозяина, тем самым способствуя ослаблению противовирусного ответа, вызываемого хозяином.
Область субгеномного промотора альфавируса (SGP) расположена перед интересующим геном (GOI). Элемент SGP облегчает инициацию транскрипции GOI, минуя считывание последовательности, кодирующей вирусные белки nsP.
Рис.2. Синтез и клеточный анализ saRNA eGFP платформы Yaohai Bio-Pharma RNASci.
Протокол синтеза saРНК аналогичен мРНК: Синтез индивидуальной мРНК