Все категории
ENEN
проектирование последовательности mRNA

проектирование последовательности mRNA

Главная страница >  IVT РНК  >  Синтез РНК по индивидуальному заказу  >  Синтез пользовательского mRNA  >  проектирование последовательности mRNA

IVT РНК

проектирование последовательности mRNA

Согласно центральной догме, мессенджерная РНК (mRNA) является мостом для передачи генетического материала от ДНК к белкам.

мРНК играет биологическую роль, кодируя белки in vivo, и зрелая МРНК в эукариотических организмах состоит из пяти компонентов: 5' Кап (кап-структура), 5' НCR (некодирующая область), ОРФ (открытый прочтый фрагмент), 3' НCR и 3' полиядинозидный хвост (полиаденилатный хвост).

undefined

Детали услуг
Процесс Необязательные услуги Детали услуги Срок поставки (дни)
проектирование и оптимизация последовательности мРНК Проектирование и оптимизация кодирующих последовательностей

Сравнение последовательностей CDS

Оптимизация кодонов CDS

1
Проектирование и оптимизация некодирующих последовательностей

проектирование и оптимизация последовательности 5' UTR

проектирование и оптимизация последовательности 3' UTR

проектирование и оптимизация последовательности polyA

1-2
Настраиваемые параметры
5' UTR/3' UTR
  • Природная последовательность UTR
  • Мутантная/Инженерная последовательность UTR
3' Полиаденилатный хвост
  • хвост из 100A ~120A (рекомендуется)
  • Сегментированный полиA хвост
  • Другой пользовательский хвост
Общие стратегии для дизайна последовательности mRNA
компоненты mRNA Биологические функции Стратегии оптимизации
5' Кап Защитить mRNA от деградации экзонуклеазами и действовать в сочетании с полимерным хвостом polyA на 3' конце, белком, связывающим polyA, и фактором инициации перевода для начала синтеза белка. Естественная структура Cap1 избегает рецепторов распознавания паттернов и таким образом снижает естественный иммунный ответ, что может быть достигнуто путем одношагового ко-транскрипционного закапывания или двухшагового ферментативного закапывания [см. детали ферментативного закапывания mRNA и ко-транскрипционного закапывания].
5' НТР 5' НТР может быть распознан рибосомами, регулировать перевод mRNA и влиять на стабильность mRNA. Содержит последовательности Козак без очень устойчивой вторичной структуры. Естественные НТР высокоэкспрессируемых генов предпочтительны для транскрипции in vitro (IVT) mRNA, таких как α-глобин и β-глобин.
CDS Регионы, кодирующие белки, и последовательности, кодирующие антигены, антитела или другие функциональные белки. Оптимизация кодонов увеличивает уровень трансляции, отмечая, что некоторые неоптимальные кодоны могут играть роль в складывании белка.
3' НТР Регулируют перевод мРНК и её стабильность. Природные НТР высокоэкспрессируемых генов предпочтительны для ИВТ мРНК, таких как α-глобин и β-глобин.
3' полиядиновый хвост Регулируют экспрессию белка и защищают каповую структуру от деградации. Требуется достаточная длина (100-150 бп); кодирование полиядинового хвоста на плазмиде транскрипционного шаблона обеспечивает более определённую длину полиядинового хвоста.
Наши особенности
  • Разнообразие выбора НТР

Множество источников высокоэкспрессируемых природных и модифицированных библиотек НТР; стратегия зрелой модификации НТР;

  • Команда передового оптимизационного CDS

Сотрудничество с профессиональной командой алгоритмов ИИ для завершения оптимизации кодонов.

  • Равномерное распределение полиядерного хвоста

Добавление полиядерных последовательностей в соответствии с ДНК-шаблонами для более точного контроля длины РНК.

  • Разнообразные комбинации оптимизации

Достижение эффективного выражения РНК с низкой иммуногенностью.

Изучение кейса

Проектирование последовательности двойной отчетной РНК: мРНК mCherry-eGFP

Услуга мРНК Yaohai Bio-Pharma продолжает совершенствоваться благодаря проектированию и оптимизации тандемной последовательности двойного репортерного гена, что обеспечивает ко-выражение двух генов.

С использованием обычного трансфекционного реагента тандемная последовательность двойного гена mCherry-eGFP мРНК трансфектируется в клетки 293T, и после 48 часов обнаруживаются два флуоресцентных сигнала — mCherry (красный) и усиленный зеленый флуоресцентный белок (eGFP) с одновременным выражением, а наложенный график выделен желтым цветом.

图片

图片

Выражение мРНК mCherry-eGFP в клетках 293T

Получить бесплатную консультацию

Get in touch