Як і мРНК, які не піддаються ампліфікації, sa-РНК складається з 5'-кепа, 5'-UTR, області ORF (відкритої рамки зчитування), 3'-UTR і 3'-полі(А)-хвоста. У той час як saRNA дуже відрізняється від мРНК без ампліфікації тим, що вона містить послідовність кодування реплікази нижче 5'UTR. З кодуючими послідовностями, що перевищують 7000 нуклеотидів, вірусні білки є високо імуногенними, що обмежує розмір антигену в таких вакцинах.
TaRNA — це тип saRNA, у якому вірусна послідовність, nsPs і цікавий ген (GOI) залучені до різних мРНК, але функціонують разом. Pirjo Spuul та ін. у 2011 році вперше представив концепцію системи транс-реплікації.
Вірусна репліказа може бути nrRNA або saRNA, а мРНК, що кодують GOI, називають транс-репліконами (TR-РНК). Щоб здійснити ампліфікацію TR-РНК, консервативні елементи послідовності (5'CSE і 3'CSE) походять від альфавірусу, що фланкує GOI, з SGP альфавірусу вище за течією GOI. Конструкція taRNA враховує переваги saRNA і пом'якшує деякі їхні недоліки. Зокрема, автономні реплікази, що кодуються на платформі РНК, уникають обмежень довжини GOI і не обмежують використання модифікованих нуклеотидів.
Подальший прогрес у технології тРНК призвів до розробки вдосконаленої тРНК із областю, багатою аденіном у 5' UTR. Ця переглянута тРНК, у якій відсутній субгеномний промотор альфавірусів, призводить до коротшої РНК і 10-кратного зменшення дози вакцини, не впливаючи на рівні експресії in vitro.
Загалом, технологія тРНК все ще знаходиться в зародковому стані, але її практичне застосування багатообіцяюче. Зараз тривають доклінічні дослідження тРНК-вакцин проти вірусів грипу. Таким чином також розробляються двовалентні вакцини проти вірусів чикунгунья та Росс-Рівер.
Універсальне рішення Yaohai Bio-Pharma CRDMO для довгокодованої РНК