Самоампліфікуюча мРНК (saRNA), також відома як репліконна РНК, кодує послідовності мРНК транскрипції in vitro (IVT) і гени вірусної реплікази, отримані з альфавірусу або флавівірусу. Гени вірусної реплікази дозволяють самоампліфікувати мРНК, що призводить до збільшення експресії білка та мінімальної необхідної дози РНК у порівнянні з мРНК без ампліфікації. Інший аспект полягає в тому, що saRNA є відносно великою молекулою (більше 14 кб).
Компанія Yaohai Bio-Pharma створила набір технологій синтезу мРНК для забезпечення мРНК без ампліфікації та мРНК, що самоампліфікується (1000 нт~14000 нт), таких як розробка та оптимізація послідовності, IVT, очищення, ліофілізація та інкапсуляція ліпідних наночастинок (LNP). . Вся продукція випускається за суворими стандартами контролю якості.
Рис.1. Структурні особливості мРНК IVT: звичайна, циркулярна та самоампліфікуюча мРНК.
Самоампліфікуюча РНК складається з чотирьох неструктурних білків (позначених як nsP1, nsP2, nsP3 і nsP4), які походять від альфавірусів, вірусу венесуельського енцефаліту коней (VEEV). Серед них nsP1 демонструє подвійну ферментативну активність, а саме GTase та N7MTase, тоді як nsP2 володіє активністю RTPase, ключовою для блокування мРНК IVT для створення структури Cap 0. Крім того, nsP2 виконує роль протеази та гелікази, сприяючи складній обробці всього комплексу nsP. Точна функція nsP3 залишається невловимою, але він вступає у взаємодію з різноманітними білками клітини-господаря, тим самим сприяючи ослабленню противірусної відповіді, яку викликає господар.
Ділянка субгеномного промотора альфавірусу (SGP) розташована перед цікавим геном (GOI). Елемент SGP полегшує ініціацію транскрипції GOI шляхом обходу зчитування послідовності, що кодує білки вірусного nsP.
Рис.2 Синтез і клітинні аналізи eGFP saRNA платформи Yaohai Bio-Pharma RNASci.
Протокол синтезу саРНК подібний до мРНК: Спеціальний синтез мРНК