V roku 1994 bol popri prvej aplikácii konceptu samozvýšovacej mRNA (saRNA) použitý Semliki Forest Virus (SFV). Ďalšie dobre výskumné alfavíry, ako je Sindbis virus a venezuelský rovníkový encefalitický virus, sa tiež používajú na produkciu saRNA. SaRNA, podobne ako nezvýšovacia mRNA, obsahuje 5' kapu, 5'-UTR, oblasť otvoreného čítavého rámca (ORF), 3'-UTR a 3' poly(A) chvost.
Avšak preto, lebo ssRNA môžu sa samo replikovať s pomocou replicázy nachádzajúcej sa dolneodtokovo od 5'-UTR, sa významne líšia od nenarastajúcich mRNA. Existujú štyri neštutrúkove proteiny (nsP1, nsP2, nsP3 a nsP4), ktoré sa sekretujú z alfavírusov. nsP1 má GTase a N7MTase aktivitu, a nsP2 ukazuje RTPase aktivitu a zakončí IVT mRNA na Cap 0. Jako proteáza a helicáza tiež nsP2 usporiada spracovanie celého komplexa nsP. nsP3 hraje úlohu v inhibícii antivírusovej odpovede cez interakciu s niekoľkými hostitelskými bunkovými proteínmi. Najviac konzervatívny proteín u alfavírusov je nsP4, ktorý poskytuje RNA-závislú RNA polymerázu (RdRp) funkciu a zvyšuje počet kópií pôvodnej ITV mRNA.
Tento vírusový protein je vysoce imunogénny, s kódovou sekvenciou viac ako 7 000 bázových pár, čo obmedzuje veľkosť antigenov v takých vakcínach.
Aplikácia saRNA
saRNA vakcíny proti vírusovým patogenom
V septembri 2023 oznámili spoločnosti Arcturus Therapeutics a CSL, že EMA schválila ich žiadosť o trhovú autorizáciu (MAA) pre vakcínu ARCT-154, samovzostupnú mRNA (sa-mRNA) vakčinu na prevenciu COVID-19. Arcturus a CSL očakávajú rozhodnutie Európskej komisie v roku 2024. Japonské MHLW schválilo ARCT-154 v decembri 2023.
Vakčina ARCT-154 je založená na venezuelskom encefalitickom víruse koní (VEEV) a skladá sa z replikonu, v ktorom sú štrukturálne proteiny VEEV nahradené jadrovými proteínmi SARS-CoV-2. V porovnaní s prvého generácie mRNA vakčinou pre posilovač, ARCT-154 ukazuje nehoršie vlastnosti voči pôvodnému štremu a lepšiu imunogennosť voči variante omikron BA.4/5.
Ďalšie saRNA-bazované vakčiny sú v klinických alebo predklinických skúškach. Tieto vakčiny sú namierené proti patogenom, vrátane SARS-CoV-2, chľadnivého vírusa, vírusa blázne, vírusa Zika, vírusa Ebola, VEEV, HIV-1 a určitým mikrobiomom spôsobujúcim bakteriálne infekcie alebo parazitárne nádory, ako aj rakovine.
Yaohai’s Bio-Pharma Komplexné CRDMO Riešenie pre Dlhodobé Kódovanie RNA