Al igual que los ARNm no amplificables, el ARNsa consta de una tapa 5', una UTR 5', una región ORF (marco de lectura abierto), una UTR 3' y una cola poli(A) 3'. Mientras que el ARNsa es muy diferente del ARNm no amplificador en que contiene la secuencia codificante de la replicasa aguas abajo de la 5'UTR. Con secuencias codificantes que superan los 7000 nucleótidos, las proteínas virales son altamente inmunogénicas, lo que limita el tamaño del antígeno en dichas vacunas.
TaRNA es un tipo de saRNA en el que la secuencia viral, las nsP y el gen de interés (GOI) están involucrados en diferentes ARNm pero funcionan juntos. Pirjo Spuul et al. introdujo el concepto de un sistema de trans-replicación por primera vez en 2011.
La replicasa viral puede ser nrRNA o saRNA, y los mRNA que codifican GOI se denominan trans-replicones (TR-RNA). Para realizar la amplificación de TR-RNA, los elementos de secuencia conservados (5'CSE y 3'CSE) provienen del alfavirus que flanquea el GOI, con el SGP del alfavirus aguas arriba del GOI. El diseño de taRNA tiene en cuenta las ventajas de los saRNA y palia algunas de sus desventajas. En particular, las replicasas independientes que codifican en una plataforma de ARN evitan las limitaciones de la longitud de los GOI y no restringen el uso de nucleótidos modificados.
Otros avances en la tecnología de taRNA han dado como resultado el desarrollo de un taRNA mejorado con una región rica en adenina en la UTR 5'. Este taRNA revisado que carece del promotor subgenómico de los alfavirus da como resultado un ARN más corto y una disminución de 10 veces en la dosis de la vacuna, sin afectar los niveles de expresión in vitro.
En general, la tecnología taRNA está todavía en sus inicios, pero sus aplicaciones prácticas son prometedoras. Actualmente se están realizando estudios preclínicos de vacunas taRNA contra los virus de la influenza. También se están desarrollando vacunas bivalentes contra los virus chikungunya y del río Ross.
Solución CRDMO integral de Bio-Pharma de Yaohai para ARN de codificación larga
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