Al igual que las mRNA no amplificables, la sa-RNA consta de un cap 5', un UTR 5', una región ORF (marco de lectura abierto), un UTR 3' y una cola poli(A) 3'. Sin embargo, la saRNA es muy diferente de la mRNA no amplificadora en el sentido de que contiene la secuencia codificante de replicasa aguas abajo del UTR 5'. Con secuencias codificantes que superan los 7000 nucleótidos, las proteínas virales son altamente inmunogénicas, lo que limita el tamaño del antígeno en dichas vacunas.
El taRNA es un tipo de saRNA en el que la secuencia viral, los nsPs y el gen de interés (GOI) están involucrados en diferentes mRNA pero funcionan juntos. Pirjo Spuul et al. introdujeron por primera vez el concepto de un sistema de replicación trans en 2011.
La replicasa viral puede ser nrRNA o saRNA, y los mRNAs que codifican GOIs se denominan trans-replicones (TR-RNAs). Para amplificar el TR-RNA, elementos de secuencia conservados (5'CSE y 3'CSE) del alfavirus flanquean al GOI, con el promotor subgenómico del alfavirus ubicado aguas arriba del GOI. El diseño de taRNA tiene en cuenta las ventajas de los saRNAs y alivia algunas de sus desventajas. En particular, las replicasas independientes codificadas en una plataforma de RNA evitan las limitaciones de la longitud de los GOIs y no restringen el uso de nucleótidos modificados.
Avances adicionales en la tecnología de taRNA han dado lugar al desarrollo de un taRNA mejorado con una región rica en adenina en el UTR 5'. Este taRNA revisado, que carece del promotor subgenómico de los alfavirus, resulta en un RNA más corto y una disminución de 10 veces en la dosis de la vacuna, sin afectar los niveles de expresión in vitro.
En general, la tecnología taRNA aún está en su infancia, pero sus aplicaciones prácticas son prometedoras. Se están llevando a cabo estudios preclínicos de vacunas taRNA contra virus de la influenza. También se están desarrollando vacunas bivalentes contra los virus del chikunguña y del río Ross de esta manera.
Solución Integral de CRDMO de Bio-Farma de Yaohai para RNA de Carga Larga
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