Stejně jako neamplifikovatelné mRNA se sa-RNA skládá z 5' čepičky, 5' UTR, oblasti ORF (otevřený čtecí rámec), 3' UTR a 3' poly(A) konce. Zatímco saRNA je velmi odlišná od neamplifikující mRNA v tom, že obsahuje replikázovou kódující sekvenci downstream od 5'UTR. S kódujícími sekvencemi přesahujícími 7000 nukleotidů jsou virové proteiny vysoce imunogenní, což omezuje velikost antigenu v takových vakcínách.
TaRNA je typ saRNA, ve kterém jsou virová sekvence, nsPs a požadovaný gen (GOI) zapojeny do různých mRNA, ale fungují společně. Pirjo Spuul a kol. představil koncept trans-replikačního systému poprvé v roce 2011.
Virová replikáza může být nrRNA nebo saRNA a mRNA kódující GOI se nazývají trans-replikony (TR-RNA). Pro provedení amplifikace TR-RNA pocházejí konzervované sekvenční prvky (5'CSE a 3'CSE) z alfaviru lemujícího GOI, přičemž SGP alfaviru upstream od GOI. Návrh taRNA bere v úvahu výhody saRNA a zmírňuje některé jejich nevýhody. Zejména samostatné replikázy kódující v platformě RNA se vyhýbají omezením délky GOI a neomezují použití modifikovaných nukleotidů.
Další pokroky v technologii taRNA vedly k vývoji vylepšené taRNA s oblastí bohatou na adenin v 5' UTR. Tato revidovaná taRNA postrádající subgenomický promotor alfavirů vede ke kratší RNA a 10násobnému snížení dávky vakcíny, aniž by to ovlivnilo hladiny exprese in vitro.
Celkově je technologie taRNA stále v plenkách, ale její praktické aplikace jsou slibné. V současné době probíhají preklinické studie taRNA vakcín proti chřipkovým virům. Tímto způsobem jsou vyvíjeny i bivalentní vakcíny proti virům chikungunya a Ross River.
Řešení Yaohai Bio-Pharma One-Stop CRDMO pro dlouho kódující RNA