Samoozbrojující se mRNA (saRNA), také známá jako replikon RNA, kóduje sekvence in vitro transkripcí (IVT) mRNA a virální replikázy geny odvozené z alphavirů nebo flavivirů. Virální geny replikázy umožňují samoozbrojení mRNA, což vede ke zvýšenému výrazu bílkoviny a minimální požadované dávce RNA ve srovnání s neozbrojujícími se mRNA. Dalším aspektem je, že saRNA je relativně velká molekula (více než 14 kb).
Yaohai Bio-Pharma vyvinula sadu technologií pro syntézu mRNA, která poskytuje neamplifikovanou mRNA a samoopakovnou mRNA (1000 nt~14000 nt), jakožto návrh a optimalizace sekvence, IVT, čištění, lyofilizace a encapsulace do lipidových nanocastic (LNP). Všechny produkty jsou uvolňovány za přísných standardů kontroly kvality.
Obr.1 Strukturní vlastnosti IVT mRNA: Konvenční, kruhová a samoopakovná mRNA.
Samovzbuzovaná RNA obsahuje čtyři nestrukturní proteiny (označené jako nsP1, nsP2, nsP3 a nsP4), které pocházejí z alfavirů, konkrétně z venezuelského viru encefalitidy koní (VEEV). Mezi nimi nsP1 projevuje dvojí enzymatickou aktivitu, totiž GTase a N7MTase, zatímco nsP2 má RTPase aktivitu, což je klíčové pro zakončení IVT mRNA a vytvoření struktury Cap 0. Navíc slouží nsP2 jako proteasa a helicase, čímž usnadňuje komplexní zpracování celého nsP komplexu. Přesná funkce nsP3 zůstává nejasná, ale interaguje s různými hostitelskými buněčnými proteiny, čímž přispívá ke zmírnění antivirové odpovědi hostitele.
Region subgenomického promotoru (SGP) alfaviru se nachází před genem interesu (GOI). Prvek SGP umožňuje iniciování transkripce GOI přeskočením čtení sekvence kódující virální nestrukturní proteiny nsP.
Obr.2 Syntéza a buněčné asay eGFP saRNA na platformě RNASci Yaohai Bio-Pharma.
Protokol syntézy saRNA je podobný mRNA: Vlastní syntéza mRNA