Assim como as mRNAs não amplificáveis, o sa-RNA consiste em um cap 5', um UTR 5', uma região ORF (quadro de leitura aberto), um UTR 3' e uma cauda poly(A) 3'. Enquanto isso, o saRNA é muito diferente da mRNA não amplificadora porque contém a sequência codificadora de replicase logo após o UTR 5'. Com sequências codificantes excedendo 7000 nucleotídeos, as proteínas virais são altamente imunogênicas, limitando assim o tamanho do antígeno em tais vacinas.
O taRNA é um tipo de saRNA no qual a sequência viral, nsPs e o gene de interesse (GOI) estão envolvidos em diferentes mRNAs, mas funcionam juntos. Pirjo Spuul et al. introduziram o conceito de um sistema de replicação trans pela primeira vez em 2011.
A replicase viral pode ser nrRNA ou saRNA, e os mRNAs que codificam GOIs são chamados de trans-replicons (TR-RNAs). Para amplificar o TR-RNA, elementos de sequência conservados (5’CSE e 3’CSE) do alfavírus flanqueiam o GOI, com o SGP do alfavírus a montante do GOI. O design de taRNA leva em consideração as vantagens dos saRNAs e alivia algumas de suas desvantagens. Em particular, replicases autônomas codificadas em uma plataforma RNA evitam as limitações de comprimento dos GOIs e não restringem o uso de nucleotídeos modificados.
Avanços adicionais na tecnologia de taRNA resultaram no desenvolvimento de um taRNA melhorado com uma região rica em adenina no 5' UTR. Este taRNA revisado, carecendo do promotor subgenômico dos alfavírus, resulta em um RNA mais curto e uma redução de 10 vezes na dose da vacina, sem afetar os níveis de expressão in vitro.
No geral, a tecnologia taRNA ainda está em sua infância, mas suas aplicações práticas são promissoras. Estudos pré-clínicos de vacinas taRNA contra vírus da gripe estão atualmente em andamento. Vacinas bivalentes contra os vírus chikungunya e Ross River também estão sendo desenvolvidas dessa forma.
Solução Integral de CRDMO da Yaohai para RNA de Longa Codificação