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비 증폭형 mRNA와 마찬가지로 sa-RNA는 5' 캡, 5' UTR, ORF(열린 읽기 틀) 영역, 3' UTR 및 3' poly(A) 꼬리로 구성됩니다. 그러나 saRNA는 5'UTR의 하류에 복제 효소 코딩 서열을 포함하고这一点에서 비증폭 mRNA와 매우 다릅니다. 7000 염기 이상의 인코딩 서열을 가진 바이러스 단백질은 높은 면역원성을 가지므로 이러한 백신에서 항원 크기가 제한됩니다.
TaRNA는 바이러스 서열, nsPs 및 관심 유전자(GOI)가 서로 다른 mRNA에 관여하지만 함께 작용하는 saRNA의 일종입니다. Pirjo Spuul 등은 2011년 처음으로 trans-복제 시스템 개념을 도입했습니다.
바이러스 복제효소는 nrRNA 또는 saRNA일 수 있으며, GOIs를 인코딩하는 mRNA들은 전복 복제자(trans-replicons, TR-RNAs)라고 불립니다. TR-RNA 증폭을 위해 보존된 시퀀스 요소(5’CSE와 3’CSE)가 알파바이러스의 플랭크에 GOI를 둘러싸고, 알파바이러스의 하위 게놈 프로모터(SGP)는 GOI 앞에 위치합니다. taRNA 설계는 saRNA의 장점을 고려하면서 일부 단점을 완화시킵니다. 특히, RNA 플랫폼에 인코딩된 독립형 복제효소는 GOI 길이의 제한을 피하고 변형된 핵산의 사용을 제한하지 않습니다.
TaRNA 기술의 추가적인 발전으로 5' UTR에 아데닌이 풍부한 영역을 가진 개선된 taRNA가 개발되었습니다. 이 수정된 taRNA는 알파바이러스의 하위 게놈 프로모터가 없어 더 짧은 RNA를 생성하며, 체외 발현 수준에는 영향을 주지 않으면서 백신 용량을 10배 줄였습니다.
전반적으로 taRNA 기술은 아직 초기 단계에 있지만, 그 실용적 응용 가능성은 매우 유망합니다. 현재 인플루엔자 바이러스에 대한 taRNA 백신의 사전 임상 연구가 진행 중입니다. 또한 카운드냐와 로스 리버 바이러스를 대상으로 하는 2가 백신도 이러한 방식으로 개발되고 있습니다.
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