Minicircle DNA (mcDNA), ebeveyn plazmit DNA benzeri bir yapıdan türetilen daha küçük, viral olmayan bir DNA vektörüdür. Minicircle DNA, replikasyon kaynağı (ORI) ve seçim işaretleyicisi (selMark) olmaksızın promotor ve ilgilenilen geni (GOI) içermesi açısından geleneksel plazmid DNA'dan farklıdır. Minicircle DNA, plazmid DNA'dan fazladan dizileri (mini plazmit olarak adlandırılır) çıkarmak için in vivo rekombinasyon yoluyla bakterilerde üretilir. Güvenliği nedeniyle minicircle DNA, gen terapisi, DNA aşıları vb. için viral olmayan bir vektör olarak popülerlik kazanmıştır.
Şekil 1. Plazmid DNA (pDNA) ve Minicircle DNA'nın (mcDNA) Yapısı
Minicircle DNA Rekombinasyon Sistemleri
Phage λ integraz, Phage P1 Cre rekombinaz, ParA resolvase, PhiC31 integra se/I-SceI dahil olmak üzere incelenen dört ana mini daire DNA in vivo rekombinasyon sistemi vardır.
Stratejileri
|
Faj λ integrali
|
Faj P1 Cre rekombinaz
|
ParA çözünürlüğü
|
PhiC31 integra se/I-SceI
|
Mekanizma
|
Att hibrit bölgelerinin rekombinasyonunu katalize etmek için FIS ve IHF proteinleri aracılığıyla işlev gören tirozin rekombinaz
|
LoxP bölgelerine bağlanırken çift yönlü rekombinasyon gerçekleştiren bölgeye özgü tirozin rekombinaz
|
İki özdeş MRS bölgesi arasında geri dönüşü olmayan ve tek yönlü bir rekombinasyon gerçekleştiren serin rekombinaz
|
AttP/attB bağlanma bölgeleri arasında tek yönlü rekombinasyona aracılık eden serin rekombinaz, I-SceI endonükleaz ise ürünle ilgili safsızlıkları ve birleşmemiş ana plazmidi böler
|
Özellikler
|
FIS ve IHF konakçı faktörlerinin ifadesine bağlıdır; içsel toksisite; Artık ebeveyn plazmid ve mini plazmit
|
Artık ebeveyn plazmid ve mini plazmit
|
Yüksek verim; Artık ebeveyn plazmid ve mini plazmit
|
Ebeveyn plazmidinin bozulmasıyla ilişkili verimin azalması
|
Yaohai Bio-Pharma Minicircle DNA için Tek Noktadan CDMO Çözümü Sunuyor
Referans:
[1] Almeida AM, Queiroz JA, Sousa F, Sousa Â. Minicircle DNA: DNA Tabanlı Vektörlerin Geleceği mi? Trendler Biyoteknoloji. 2020 Ekim;38(10):1047-1051. doi: 10.1016/j.tibtech.2020.04.008.