Analiza |
Metode |
Molekularna teža |
Tekočinska kromatografija-masna spektrometrija (LC-MS)/tekočinska kromatografija/masna spektrometrija z elektrosprejem (LC/ES-MS) nedotaknjenih, reduciranih in N-deglikoziliranih proteinov |
Analiza variant velikosti |
LC-MS, velikostno izključitvena kromatografija – masna spektrometrija (SEC-MS), dinamično sipanje svetlobe (DLS), analitično ultracentrifugiranje (AUC), velikostno izključitvena kromatografija – večkotno sipanje svetlobe (SEC-MALS) |
Analiza variant naboja |
LC-MS, ionsko izmenjevalna kromatografija-masna spektrometrija (IEX-MS) |
Toplotna stabilnost (Tm) |
Diferencialni vrstični kalorimeter (DSC) |
Koeficient ekstinkcije |
Analizatorji aminokislin |
Kartiranje peptidov |
LC-MS po razgradnji s proteazo |
Pokritost beljakovinske sekvence |
LC-MS po eni-tri razklopu |
N-terminalno zaporedje |
LC-MS po prebavi, določeno s preslikavo peptidov, Edmanova razgradnja |
C-terminalno zaporedje |
LC-MS po prebavi |
Disulfidne vezi |
LC-MS po prebavi |
Proste sulfhidrilne skupine |
Ellmanov test |
Oksidacija aminokislin |
LC-MS, tekočinska kromatografija visoke ločljivosti (RP-HPLC) z reverzno fazo ali hidrofobna interakcijska kromatografija – tekočinska kromatografija visoke ločljivosti (HIC-HPLC) in masna spektrometrija (MS) |
Izomerizacija aminokislin |
LC-MS po encimski cepitvi |
Deamidacija |
LC-MS po encimski cepitvi |
Modifikacija N-terminala |
LC-MS po prebavi |
Modifikacija C-terminala |
LC-MS po prebavi |
C-terminalni izrez lizina |
LC-MS po prebavi |
Profiliranje N-glikana |
LC-MS sproščenih glikanov |
Mesto N-glikozilacije |
LC-MS po encimski cepitvi |
Zasedenost mesta N-glikozilacije |
LC-MS po razgradnji z deglikozilazo in proteazo (tripsin ali Asp-N) |
Struktura višjega reda |
Krožni dikroizem (CD) Infrardeči spektrometer (IR) |