Rekombinantne beljakovine pogosto opazijo oksidacijo izpostavljenih stranskih verig aminokislin, kot sta triptofan (Trp) in metionin (Met), kar spremeni fizikalno-kemijske lastnosti beljakovin. Te spremembe lahko nato prispevajo k spreminjanju bioloških funkcij prizadetih proteinov, kot je izguba vezave, zmanjšanje encimske aktivnosti, nepričakovano hiter očistek. Beljakovine so pomembne tarče za oksidativne reakcije, ker hitro reagirajo z oksidanti in jih je veliko v celicah, zunajceličnih tkivih in telesnih tekočinah.
Zato je spremljanje oksidacije beljakovin ključnega pomena za uspešen biofarmacevtski razvoj.
Yaohai Bio-Pharma ponuja storitev analize oksidacije aminokislin, ki vam omogoča določanje oksidacije aminokislin s tekočinsko kromatografijo-masno spektrometrijo (LC-MS).
Sodelovali smo pri strukturni karakterizaciji beljakovin različnih velikih molekul, vključno z rekombinantnimi podenotnimi cepivi, nanotelesi/VHH/protitelesi z eno domeno (sdAbs), fragmenti protiteles, hormoni/peptidi, citokini, rastni faktorji (GF), encimi, kolageni, itd.
Regulativne zahteve za oksidacijo aminokislin
V skladu s smernicami ICH Q6B je mogoče oksidirane oblike odkriti in označiti s kromatografskimi, elektroforetičnimi in/ali drugimi ustreznimi analitskimi metodami (npr. tekočinska kromatografija visoke ločljivosti (HPLC), kapilarna elektroforeza, masna spektroskopija, krožni dikroizem).
Analitske metode
Analiza |
Metode |
Oksidacija aminokislin |
LC-MS, tekočinska kromatografija visoke ločljivosti z reverzno fazo (RP-HPLC) ali hidrofobna interakcijska kromatografija tekočinska kromatografija visoke ločljivosti (HIC-HPLC) in masna spektrometrija |
Analitični postopki
1. Priprava vzorca
2. LC-MS
3. Analiza podatkov
Ostanki triptofana (Trp) so še posebej nagnjeni k oksidaciji zaradi visoke reaktivnosti aromatskega indola z reaktivnimi kisikovimi spojinami. Trp oksidacija zahteva nekaj izpostavljenosti ostankom Trp, ki so običajno zakopani v tridimenzionalni strukturi proteina.
Ko pa se ostanki Trp oksidirajo, se lahko pretvorijo v različne produkte z zelo različnimi lastnostmi od prvotnega Trp. Najpogostejša pot oksidacije Trp vključuje tvorbo N-formilkinurenina (masna razlika: +32).
Druga pogosto oksidirana aminokislina je metionin. Atom žvepla v ostanku Met lahko sprejme enega ali dva atoma kisika, kar vodi do tvorbe sulfoksida (masna razlika: +16) ali sulfona (masna razlika: +32), ustrezno. Ta sprememba je razmeroma pogosta zaradi tipično visoke površinske izpostavljenosti Met.