1994. gadā parastāk tika izmantots savrupojamo mRNA (saRNA) koncepts, pielietojot Semliki Meža Vīrusu (SFV). Citas labi pētītas alfavīrusu šķiras, piemēram, Sindbis vīruss un Venesuelas ekvīnu encefalīta vīruss, tiešām arī tiek izmantotas saRNA ražošanai. SaRNA, līdzīgi neierupojamai mRNA, ietver 5’ kapu, 5’-UTR, atvērto lasīšanas freimu (ORF) apgabalu, 3’-UTR un 3’ poli(A) repi.
Tomēr tāpēc, ka ssRNA var pašreplikēties ar replicēsas palīdzību, kas atrodas 5'-UTR lejaplodī, tie atšķiras no neamplificējošajiem mRNA. No alfavīru tiek sekretēti četri nestrukturnie proteīni (nsP1, nsP2, nsP3 un nsP4). nsP1 ir GTaze un N7MTaze aktivitāte, bet nsP2 parāda RTPazē aktivitāti un kapsē IVT mRNA, veidojot Kapu 0. Kā proteīze un helicēze, nsP2 arī ļauj apstrādāt visu nsP kompleksu. nsP3 piedalās antivīrusa atbildes inhibēšanā, saistoties ar vairākiem dzīvokļa līdzekļu proteīniem. Visvairāk konservertais alfavīru proteīns ir nsP4, kurš nodrošina RNA-atkarīgu RNA polimerēzi (RdRp) funkciju un palielina sākotnējā ITV mRNA kopijas skaitu.
Šis vīrusa proteīns ir ļoti imunogēnisks, ar kodēšanas secību vairāk nekā 7000 bāzu pāriem, kas ierobežo antigena izmēru šādos vakcinācijas gadījumos.
SaRNA pielietojums
saRNA vakcīnas pret vīrusa patogeniem
Septembrī 2023. gadā Arcturus Therapeutics un CSL paziņoja, ka EMA ir pieņēmusi tās Marketa Autorizācijas Pieprasījumu (MAA) ARCT-154 vakcinai, kas ir pašpalielināmās mRNA (sa-mRNA) vakcīna pret COVID-19. Arcturus un CSL gaida Eiropas Komisijas lēmumu par atļauju 2024. gadā. Japānas MHLW pieņēma ARCT-154 decembrī 2023. gadā.
ARCT-154 vakcīna balstās uz Venesuelas zirgu encefalīta virusu (VEEV) un sastāv no replikona, kurā VEEV strukturālajiem proteiniem ir aizstājušies SARS-CoV-2 kodolproteinji. Salīdzinājumā ar pirmās paaudzes mRNA vakcīnu priedēm, ARCT-154 parāda neinferiāli rezultātus oriģinālajam štrādam un augstāku imūnogennostu omikrona BA.4/5 variantam.
Vairākas citas saRNA-bazētās vakcīnas tiek izmēģinātas kliniskajos vai prekliniskajos pētījumos. Šīs vakcīnas mērķtiecīgi cīnās ar patogeniem, tostarp SARS-CoV-2, gripa virusu, sivs virusu, Zikas virusu, Ebolas virusu, VEEV, HIV-1 un noteiktām mikroorganismu veidām, kas izraisa baktēriālas infekcijas vai parasītu uznāves, kā arī ar vistu.
Yaohai Biofarmaceitiskais vienotais CRDMO risinājums gariga kodējoša RNA gadījumos