Miniringi DNA (mcDNA) on väiksem mitteviiruslik DNA vektor, mis on tuletatud vanemplasmiidse DNA sarnasest struktuurist. Miniringi DNA erineb tavapärasest plasmiidsest DNA-st selle poolest, et see sisaldab promootorit ja huvipakkuvat geeni (GOI), ilma replikatsiooni alguspunkti (ORI) ja selektsioonimarkerita (selMark). Miniringi DNA toodetakse bakterites in vivo rekombinatsiooni teel, et eemaldada plasmiidsest DNA-st lisajärjestusi (nimetatakse miniplasmiidiks). Tänu oma ohutusele on miniringi DNA kogunud populaarsust geeniteraapia, DNA vaktsiinide jms mitteviirusliku vektorina.
Joonis 1. Plasmiidse DNA (pDNA) ja miniringi DNA (mcDNA) struktuur
Miniringi DNA rekombinatsioonisüsteemid
Uuritud on neli peamist miniringi DNA in vivo rekombinatsioonisüsteemi, sealhulgas faagi λ integraas, faagi P1 Cre rekombinaas, ParA resolvaas, PhiC31 integra se/I-SceI.
|
Strateegia
|
Faagi λ integraas
|
Faag P1 Cre rekombinaas
|
ParA resolvaas
|
PhiC31 integra se/I-SceI
|
|
Mehhanism
|
Türosiini rekombinaas, mis toimib valkude FIS ja IHF kaudu, et katalüüsida att hübriidsaitide rekombinatsiooni
|
Saidispetsiifiline türosiini rekombinaas, mis teostab loxP saitidega seondumisel kahesuunalise rekombinatsiooni
|
Seriini rekombinaas, mis viib läbi pöördumatu ja ühesuunalise rekombinatsiooni kahe identse MRS-saidi vahel
|
Seriini rekombinaas, mis vahendab ühesuunalist rekombinatsiooni attP/attB sidumissaitide vahel, samas kui I-SceI endonukleaas lõhustab tootega seotud lisandid ja rekombineerimata vanemplasmiidi
|
|
FUNKTSIOONID
|
Sõltub peremeesfaktorite FIS ja IHF ekspressioonist; sisemine toksilisus; Vanemliku jääkplasmiid ja miniplasmiid
|
Vanemliku jääkplasmiid ja miniplasmiid
|
Kõrge saagikus; Vanemliku jääkplasmiid ja miniplasmiid
|
Vanemliku plasmiidi lagunemisega seotud saagis vähenes
|
Yaohai Bio-Pharma pakub ühekordset CDMO-lahendust miniringi DNA jaoks
Viide:
[1] Almeida AM, Queiroz JA, Sousa F, Sousa Â. Miniringi DNA: DNA-põhiste vektorite tulevik? Trends Biotechnol. 2020 oktoober;38(10):1047-1051. doi: 10.1016/j.tibtech.2020.04.008.
ET
EN
AR
HR
CS
DA
NL
FI
FR
DE
EL
IT
JA
KO
EI
PL
PT
RO
RU
ES
SV
IW
ID
LV
LT
SR
SK
SL
UK
VI
HU
TH
TR
FA
AF
MS
BE
MK
UR
BN
