ДНК міні-круга (мкДНК) - гэта меншы невірусны вектар ДНК, які паходзіць з бацькоўскай плазміднай ДНК-падобнай структуры. ДНК міні-кола адрозніваецца ад звычайнай плазміднай ДНК тым, што змяшчае промотор і цікавы ген (GOI), без паходжання рэплікацыі (ORI) і маркера адбору (selMark). ДНК міні-кола вырабляецца ў бактэрыях шляхам рэкамбінацыі in vivo для выдалення лішніх паслядоўнасцей (так званых міні-плазмід) з плазмидной ДНК. Дзякуючы сваёй бяспецы ДНК мініцыркуля набыла папулярнасць як невірусны вектар для геннай тэрапіі, ДНК-вакцын і г.д.
Малюнак 1. Структура плазмидной ДНК (пДНК) і мініцыркульнай ДНК (мкДНК)
Мінікругавыя сістэмы рэкамбінацыі ДНК
Існуюць чатыры асноўныя сістэмы рэкамбінацыі ДНК у мініцыркуле in vivo, якія былі вывучаны, у тым ліку інтэграза фага λ, рэкамбіназа фага P1 Cre, рэзальваза ParA, інтэграза PhiC31 se/I-SceI.
Стратэгія
|
Фаг λ-інтэграза
|
Рэкамбіназа фага P1 Cre
|
Рэзолваза ParA
|
PhiC31 integra se/I-SceI
|
Механізм
|
Тыразінрэкамбіназа, якая функцыянуе праз вавёркі FIS і IHF, каб каталізаваць рэкамбінацыю гібрыдных сайтаў att
|
Сайт-спецыфічная тыразінрэкамбіназа, якая выконвае двухнакіраваную рэкамбінацыю пры звязванні з сайтамі loxP
|
Серін-рэкамбіназа, якая выконвае незваротную і аднанакіраваную рэкамбінацыю паміж двума ідэнтычнымі MRS-сайтамі
|
Серін-рэкамбіназа, якая забяспечвае аднанакіраваную рэкамбінацыю паміж сайтамі звязвання attP/attB, у той час як эндануклеаза I-SceI расшчапляе звязаныя з прадуктам прымешкі і нерэкамбінаваную бацькоўскую плазміду
|
Асаблівасці
|
Залежаць ад экспрэсіі фактараў гаспадара FIS і IHF; унутраная таксічнасць; Рэшткавая бацькоўская плазміда і міні-плазміда
|
Рэшткавая бацькоўская плазміда і міні-плазміда
|
Высокая ўраджайнасць; Рэшткавая бацькоўская плазміда і міні-плазміда
|
Дэградацыя бацькоўскай плазміды, звязаная са зніжэннем выхаду
|
Yaohai Bio-Pharma прапануе ўніверсальнае рашэнне CDMO для Minicircle DNA
Спасылка:
[1] Алмейда AM, Queiroz JA, Sousa F, Sousa Â. ДНК міні-кола: будучыня вектараў на аснове ДНК? Тэндэнцыі біятэхналогіі. Кастрычнік 2020 г.;38(10):1047-1051. doi: 10.1016/j.tibtech.2020.04.008.