Данные картирования пептидов на основе жидкостной хроматографии-масс-спектрометрии (ЖХ-МС) предоставят большое количество информации о первичной структуре и структуре более высокого порядка нативных и рекомбинантных белков, включая покрытие аминокислотных последовательностей, посттрансляционные модификации (PTM, например, гликозилирование). , окисление, дезамидирование), дисульфидные связи и др.
Yaohai Bio-Pharma предлагает услуги анализа пептидного картирования вашего целевого белка с помощью ЖХ-МС, чтобы ускорить ваши исследования структуры белка.
Мы принимали участие в структурной характеристике белков различных крупных молекул, включая рекомбинантные субъединичные вакцины, нанотела/VHH/однодоменные антитела (sdAbs), фрагменты антител, гормоны/пептиды, цитокины, факторы роста (GF), ферменты, коллагены, и т. д.
Нормативные требования к пептидному картированию
Руководство ICHQ6B рекомендует: «Селективное фрагментирование продукта на отдельные пептиды выполняется с использованием подходящих ферментов или химических веществ, а полученные пептидные фрагменты анализируются с помощью ВЭЖХ или другой подходящей аналитической процедуры. Пептидные фрагменты следует идентифицировать, насколько это возможно, с использованием таких методов, как анализ аминокислотного состава, N-концевое секвенирование или масс-спектрометрия (МС). Пептидное картирование активного вещества или лекарственного препарата (ЛП) с использованием проверенного метода — это метод, который часто используется для подтверждения желаемой структуры продукта для выпуска серии».
Аналитические методы
Анализ |
методы |
Картирование пептидов |
Протеазное расщепление и жидкостная хроматография-масс-спектрометрия (ЖХ-МС) |
Аналитическая процедура
1. Восстановление и алкилирование.
Цель состоит в том, чтобы уменьшить дисульфидные мостики и заблокировать образующийся свободный тиол. Уменьшение дисульфидных мостиков помогает раскрыть структуру белка, что делает протеолитическое переваривание более эффективным. На этом этапе также разрушаются мостики между цепями в случае многоцепочечных белков, которые имеют дисульфидные мостики, соединяющие цепи (например, моноклональные антитела, моноклональные антитела).
2. Переваривание белка с помощью ферментов.
Цель состоит в том, чтобы расщепить белок на пептиды. Мы выбрали ферменты на основе теоретической последовательности белка и знаний о теоретическом переваривании белка ферментами. Выбор ферментов таким образом должен привести к лучшему анализу пептидного картирования.
3. Анализ переваренных пептидов Использование высокоэффективной жидкостной хроматографии с обращенной фазой в режиме онлайн с ультрафиолетовым (УФ) и масс-спектрометрическим детектором с электрораспылением (LC/ES-MS).
Разделение пептидов на основе полярности с использованием ЖХ (обратно-фазовая ЖХ)
Когда пептид элюируется из колонки ЖХ, масс-спектрометр генерирует информацию о массе вместе с информацией о фрагментных ионах, что позволяет нам определить информацию о последовательности. Мы используем информацию о последовательности для подтверждения идентичности пептида и предоставления первичной информации.
Мы также можем генерировать информацию о фрагментации пептидов, когда они поступают в источник масс-спектрометра из колонки ЖХ. В зависимости от требований исследования это либо селективная ЖХ-МС/МС, либо неселективная, которую можно рассматривать как разновидность тандемной МС.