Sarnaselt mitteamplifitseeritavatele mRNA-dele koosneb sa-RNA 5' korgist, 5' UTR-ist, ORF (avatud lugemisraami) piirkonnast, 3' UTR-ist ja 3' polü(A) sabast. Kuigi saRNA erineb mitteamplifitseerivast mRNA-st väga selle poolest, et see sisaldab replikaasi kodeerivat järjestust 5'UTR-ist allavoolu. Üle 7000 nukleotiidi ületavate kodeerivate järjestuste korral on viirusvalgud väga immunogeensed, piirates seega sellistes vaktsiinides antigeeni suurust.
TaRNA on saRNA tüüp, mille viirusjärjestus, nsP-d ja huvipakkuv geen (GOI) osalevad erinevates mRNA-des, kuid toimivad koos. Pirjo Spuul jt. tutvustas trans-replikatsioonisüsteemi kontseptsiooni esimest korda 2011. aastal.
Viiruse replikaas võib olla nrRNA või saRNA ja GOI-sid kodeerivaid mRNA-sid nimetatakse trans-replikonideks (TR-RNA). TR-RNA amplifikatsiooni tegemiseks pärinevad konserveeritud järjestuse elemendid (5'CSE ja 3'CSE) GOI-d külgnevast alfaviirusest, kusjuures alfaviiruse SGP asub GOI-st ülesvoolu. TaRNA kujundus võtab arvesse saRNA-de eeliseid ja leevendab mõningaid nende puudusi. Eelkõige väldivad RNA platvormil kodeerivad iseseisvad replikaasid GOI pikkuse piiranguid ega piira modifitseeritud nukleotiidide kasutamist.
Further advances in taRNA technology have resulted in the development of an improved taRNA with an adenine-rich region in the 5' UTR. This revised taRNA’s lacking the subgenomic promoter of alphaviruses results in a shorter RNA and a 10-fold decrease in vaccine dose, without affecting in vitro expression levels.
Overall, taRNA technology is still in its infancy, but its practical applications are promising. Preclinical studies of taRNA vaccines against influenza viruses are currently underway. Bivalent vaccines against chikungunya and Ross River viruses are also under development in this way.
Yaohai Bio-Pharma ühekordne CRDMO lahendus pika kodeeriva RNA jaoks