1994. aastal kasutati iseamplifitseeriva mRNA (saRNA) kontseptsiooni esmakordselt koos Semliki Forest Virus (SFV) rakendusega. Ja saRNA tootmiseks kasutatakse ka teisi hästi uuritud alfaviirusi, nagu Sindbis viirus ja Venezuela hobuste entsefaliidi viirus. saRNA, nagu ka mitteamplifitseeriv mRNA, sisaldab 5'-korki, 5'-UTR-i, avatud lugemisraami (ORF) piirkonda, 3'-UTR-i ja 3'-polü(A)-saba.
Kuid põhjusel, et ssRNA-d võivad 5'-UTR-ist allavoolu asuva replikaasi abil ise paljuneda, erinevad nad oluliselt mitteamplifitseerivatest mRNA-dest. Alfaviirustest erituvad neli mittestruktuurset valku (nsP1, nsP2, nsP3 ja nsP4). nsP1 omab GTaasi ja N7MTaasi aktiivsust ning nsP2 näitab RTPaasi aktiivsust ja katab IVT mRNA, moodustades Cap 0. Proteaasi ja helikaasina hõlbustab nsP2 ka kogu nsP kompleksi töötlemist. nsP3 mängib rolli viirusevastase vastuse pärssimisel, interakteerudes mitmete peremeesraku valkudega. Alfa-viiruste kõige konserveeritum valk on nsP4, mis tagab RNA-sõltuva RNA polümeraasi (RdRp) funktsiooni ja suurendab algse ITV mRNA koopiate arvu.
See viirusvalk on väga immunogeenne, kodeeriva järjestusega enam kui 7,000 aluspaari, mis piirab sellistes vaktsiinides antigeeni suurust.
saRNA rakendamine
saRNA vaktsiinid viiruse patogeenide vastu
2023. aasta septembris teatasid Arcturus Therapeutics ja CSL, et EMA kiidab heaks müügiloa taotluse (MAA) ARCT-154 vaktsiinile, mis on iseamplifitseeriv mRNA (sa-mRNA) vaktsiin COVID-19 ennetamiseks. Arcturus ja CSL ootavad Euroopa Komisjonilt heakskiitmisotsust 2024. aastal. Jaapani MHLW kiitis ARCT-154 heaks 2023. aasta detsembris.
Vaktsiin ARCT-154 põhineb Venezuela hobuste entsefaliidi viirusel (VEEV) ja koosneb replikonist, milles VEEV struktuurvalgud on asendatud SARS-CoV-2 tuumvalkudega. Võrreldes esimese põlvkonna mRNA vaktsiini revaktsineerimisega ei näita ARCT-154 esialgset tüvega halvemat toimet ja paremat immunogeensust omikronilise BA.4/5 variandi suhtes.
Mitmed teised saRNA-põhised vaktsiinid on kliinilistes või prekliinilistes uuringutes. Need vaktsiinid on suunatud patogeenide vastu, sealhulgas SARS-CoV-2, gripiviirus, marutaudiviirus, Zika viirus, Ebola viirus, VEEV, HIV-1 ja teatud mikroobid, mis põhjustavad bakteriaalseid infektsioone või parasiitinfektsioone, aga ka vähki.
Yaohai Bio-Pharma ühekordne CRDMO lahendus pika kodeeriva RNA jaoks