Analýza |
Metody |
Molekulární váha |
Kapalinová chromatografie-hmotnostní spektrometrie (LC-MS) / kapalinová chromatografie/elektrosprejová hmotnostní spektrometrie (LC/ES-MS) intaktních, redukovaných a N-deglykosylovaných proteinů |
Analýza velikostních variant |
LC-MS, Size Exclusion Chromatography-Mass Spectrometry (SEC-MS), Dynamic Light Scattering (DLS), Analytická ultracentrifugace (AUC), Size Exclusion Chromatography-Multi-Angle Light Scattering (SEC-MALS) |
Analýza variant náboje |
LC-MS, iontoměničová chromatografie-hmotnostní spektrometrie (IEX-MS) |
Tepelná stabilita (Tm) |
Diferenciální skenovací kalorimetr (DSC) |
Koeficient extinkce |
Analyzátory aminokyselin |
Mapování peptidů |
LC-MS po štěpení proteázou |
Pokrytí proteinové sekvence |
LC-MS po 1-3 digesci |
N-terminální sekvenování |
LC-MS po štěpení, stanoveno mapováním peptidu Edmanovou degradací |
C-terminální sekvenování |
LC-MS po štěpení |
Disulfidové vazby |
LC-MS po štěpení |
Volné sulfhydrylové skupiny |
Ellmanův test |
Aminokyselinová oxidace |
LC-MS, reverzní fázová vysoce výkonná kapalinová chromatografie (RP-HPLC) nebo hydrofobní interakční chromatografie-vysokoúčinná kapalinová chromatografie (HIC-HPLC) a hmotnostní spektrometrie (MS) |
Izomerizace aminokyselin |
LC-MS po enzymatickém štěpení |
Deamidace |
LC-MS po enzymatickém štěpení |
Modifikace N-terminálu |
LC-MS po štěpení |
Úprava C-terminálu |
LC-MS po štěpení |
C-koncový lysinový výstřižek |
LC-MS po štěpení |
N-glykanové profilování |
LC-MS uvolněných glykanů |
N-glykosylační místo |
LC-MS po enzymatickém štěpení |
Obsazení místa N-glykosylace |
LC-MS po štěpení deglykosylázou a proteázou (trypsin nebo Asp-N). |
Struktura vyššího řádu |
Cirkulární dichroismus (CD) Infračervený spektrometr (IR) |