Minicircle DNA (mcDNA) on pienempi ei-virallinen DNA-vektori, joka johtuu vanhemmasta plasmidin DNA-rakenteelta. Minicircle DNA eroaa perinteisestä plasmidin DNA:sta siinä, että se sisältää promotorin ja kiinnostavan geenin (GOI), ilman kopiointialustetta (ORI) ja valintamerkkiä (selMark). Minicircle DNA tuotetaan bakteereissa in vivo-uudelleensidonnassa poistaakseen ylimääräiset jonot (nimeltään mini-plasmidi) plasmidin DNA:sta. Sen turvallisuuden vuoksi minicircle DNA on saanut suosiota ei-virallisen vektorinä geeniterapian, DNA-rokotteiden jne. yhteydessä.

Kuva 1. Plasmidin DNA:n (pDNA) ja Minicircle DNA:n (mcDNA) rakenne
Minicircle DNA-uudelleensidonta järjestelmät
On neljä pääasiallista minicircle DNA:ta koskevaa in vivo-uudelleensidonta-järjestelmää, jotka on tutkittu, mukaan lukien Fagi λ integrasa, Fagi P1 Cre uudelleensidonta, ParA resolvasa, PhiC31 integrasa/I-SceI.
Strategia
|
Fagi λ integrasa
|
Fagi P1 Cre uudelleensidonta
|
ParA resolvasa
|
PhiC31 integrasa/I-SceI
|
Järjestely
|
Tyrosiinirekombinasa, joka toimii proteiinien FIS ja IHF kautta rekombinoimaan att-hybridiaineistoja
|
Paikkakohtainen tyrosiinirekombinasa, joka suorittaa kahden suuntaisen rekombinaation liitteen loxP-saittiin sidonnassa
|
Seriinirekombinasa, joka suorittaa peruuttamattoman ja yksisuuntaisen rekombinaation kahden saman MRS-saiteen välillä
|
Seriinirekombinasa, joka medioi yksisuuntaista rekombinaatiota attP/attB-sidontasaiteiden välillä, kun taas I-SceI-endonuklease leikkaa tuotearvioinnin sivutuotteita ja epärekombinoituja vanhempien plasmidien
|
PIIRTEITÄ
|
Niissä riippuu isäntätekijöiden FIS- ja IHF-ilmaisusta; sisäinen myrkyllisyys; Jäljellä olevat vanhemmat plasmidit ja mini-plasmidit
|
Jäljellä olevat vanhemmat plasmidit ja mini-plasmidit
|
Korkea tuotos; Jäljellä olevat vanhemmat plasmidit ja mini-plasmidit
|
Isäntäplasmidin hajoaminen aiheuttaa vähemmän tuotantoa
|
Yaohai Bio-Pharma tarjoaa yhdestä kätevässä CDMO-ratkaisussa minisirkeli-DNA:lle
Viittaus:
[1] Almeida AM, Queiroz JA, Sousa F, Sousa Â. Minicircle DNA: Tuleeko se olla tulevaisuus DNA-perustaisille vektoreille? Trends Biotechnol. 2020 lokak. 38(10):1047-1051. doi: 10.1016/j.tibtech.2020.04.008.