Kuten ei-amplifioituvat mRNA:t, sa-RNA koostuu 5' cap:sta, 5' UTR:stä, ORF-alueesta (avoin lukukehys), 3' UTR:stä ja 3' poly(A)-hännästä. Vaikka saRNA eroaa hyvin ei-amplifioivasta mRNA:sta siinä mielessä, että se sisältää replikaasia koodaavan sekvenssin alavirtaan 5'UTR:sta. Kun koodaavat sekvenssit ylittävät 7000 nukleotidia, virusproteiinit ovat erittäin immunogeenisiä, mikä rajoittaa antigeenin kokoa tällaisissa rokotteissa.
TaRNA on eräänlainen saRNA, jossa virussekvenssi, nsP:t ja mielenkiinnon kohteena oleva geeni (GOI) ovat mukana eri mRNA:issa, mutta toimivat yhdessä. Pirjo Spuul ym. esitteli transreplikointijärjestelmän käsitteen ensimmäistä kertaa vuonna 2011.
Viruksen replikaasi voi olla nrRNA tai saRNA, ja GOI:ita koodaavia mRNA:ita kutsutaan trans-replikoneiksi (TR-RNA:iksi). TR-RNA:n monistamisen aikaansaamiseksi konservoituneet sekvenssielementit (5'CSE ja 3'CSE) tulevat GOI:n vieressä olevasta alfaviruksesta, ja alfaviruksen SGP on GOI:sta ylävirtaan. TaRNA:n suunnittelussa otetaan huomioon saRNA:iden edut ja lievitetään joitain niiden haittoja. Erityisesti RNA-alustalla koodaavat erilliset replikaasit välttävät GOI:iden pituuden rajoitukset eivätkä rajoita modifioitujen nukleotidien käyttöä.
TaRNA-teknologian lisäedistykset ovat johtaneet parannetun taRNA:n kehittämiseen, jossa on runsaasti adeniinia sisältävä alue 5' UTR:ssä. Nämä tarkistetut taRNA:t, joista puuttuu alfavirusten subgenominen promoottori, johtavat lyhyempään RNA:han ja 10-kertaiseen rokoteannoksen pienenemiseen vaikuttamatta in vitro -ilmentymistasoihin.
Kaiken kaikkiaan taRNA-teknologia on vielä lapsenkengissään, mutta sen käytännön sovellukset ovat lupaavia. Prekliiniset tutkimukset taRNA-rokotteista influenssaviruksia vastaan ovat parhaillaan käynnissä. Tällä tavalla kehitetään myös bivalentteja rokotteita chikungunya- ja Ross River -viruksia vastaan.
Yaohain Bio-Pharma One-Stop CRDMO-ratkaisu pitkälle koodaavalle RNA:lle