สำหรับการเตรียมสารตั้งต้น RNA เป็นกลุ่ม วิธีการที่ใช้กันทั่วไปคือการถอดรหัสในหลอดทดลอง (IVT) ปฏิกิริยา IVT ใช้พลาสมิด DNA เชิงเส้นที่มีโปรโมเตอร์ T7 เป็นเทมเพลตและสังเคราะห์สารตั้งต้น RNA ที่มีนิวคลีโอไซด์ไตรฟอสเฟต (NTP) เป็นสารตั้งต้นเมื่อมี T7 RNA polymerase
วิธีการไซคลิกไลเซชันภายนอกร่างกายประกอบด้วยวิธีลิเกชันทางเคมี, ลิเกชันด้วยเอนไซม์ และวิธีเพอร์มิวเต็ดอินตรอน-เอ็กซอน (PIE) การผูกเคมีและเอ็นไซม์ผูกมัดเหมาะสำหรับการทำปฏิกิริยาไซคลิกไลเซชันของ RNA ที่สั้นกว่า เมื่อชิ้นส่วนมีขนาดใหญ่กว่า 100 nt อัตราการหมุนเวียนจะลดลงอย่างมาก ในทางตรงกันข้าม วิธีนิวคลีเอสที่ใช้ระบบ PIE สามารถบรรลุการวนรอบลำดับ 8 kb
ภายใต้การเร่งปฏิกิริยาของกัวโนซีน ไตรฟอสเฟต (GTP) โครงสร้าง PIE จะผ่านการหมุนเวียนของลำดับอินตรอนพิเศษ เมื่อรวมกับกลยุทธ์ที่เหมาะสมในการเพิ่มอัตราการเป็นวงรอบแล้ว Yaohai Bio-Pharma ก็สามารถบรรลุการวนเป็นลำดับได้สูงสุดถึง 4 kb โดยมีประสิทธิภาพในการเป็นวงมากกว่า 80%
ปฏิกิริยาการหมุนเวียนของ RNA ในหลอดทดลอง จะเป็นดังนี้:
สารตั้งต้น RNA ถูกสังเคราะห์โดยการถอดรหัส ในหลอดทดลอง และส่วนประกอบ PIE ทำการประกบตัวเองจนเสร็จสมบูรณ์ภายใต้การเร่งปฏิกิริยาของ GTP เพื่อสร้าง circRNA
กระบวนการ | รายละเอียดบริการ | ระยะเวลาจัดส่ง (วันทำงาน) |
การถอดรหัสและการไหลเวียน ในหลอดทดลอง | การยืนยันระบบปฏิกิริยา | 1-2 |
ปฏิกิริยาการถอดรหัสและการเกิดไซคลิก ในหลอดทดลอง | ||
การย่อยอาหาร RNase R | ||
การเพิ่มประสิทธิภาพปฏิกิริยา | องค์ประกอบของปฏิกิริยา การปรับเวลาให้เหมาะสม | 2-5 |
สามารถสร้าง RNA cyclization ได้สูงสุด 4 kb
อัตราการหมุนเวียนที่มากกว่า 80% สามารถทำได้ผ่านกลยุทธ์การหาค่าเหมาะที่สุดสำหรับลำดับที่มีเหตุมีผล
ด้วยการควบคุม RNases ที่เข้มงวดในสภาพแวดล้อมการทดลองและวัสดุสิ้นเปลือง จึงป้องกันการเสื่อมสลายของ RNA ได้อย่างมีประสิทธิภาพ
การหมุนเวียน ในหลอดทดลอง และการเพิ่มคุณค่าของ circRNA
Yaohai Bio-Pharma อาศัยระบบ PIE ปรับปรุงลำดับของ circRNA โดยมีอัตราการหมุนเวียนมากกว่า 80% โดย agarose gel electrophoresis (AGE) การใช้ RNase R เพื่อเพิ่มคุณค่าให้กับ circRNA ผลลัพธ์ของ E-gel electrophoresis แสดงให้เห็นว่าสารตั้งต้น RNA เชิงเส้นถูกย่อย และหลังจากการทำให้บริสุทธิ์เพิ่มเติมแล้ว circRNA ที่ขาดหายไปส่วนใหญ่ก็สามารถกำจัดออกได้ โซลูชันการทำให้บริสุทธิ์ได้รับการพัฒนาด้วยตนเองโดย Yaohai Bio-Pharma
การไหลเวียน ในหลอดทดลอง และการเพิ่มคุณค่าของ circRNA