Liksom icke-amplifierbara mRNA, består sa-RNA av en 5'-kapsel, en 5'-UTR, en ORF-region (öppen läsram), en 3'-UTR och en 3'-poly(A)-svans. Medan saRNA skiljer sig mycket från icke-amplifierande mRNA genom att det innehåller replikaskodningssekvensen nedströms om 5'UTR. Med kodande sekvenser som överstiger 7000 nukleotider är virala proteiner mycket immunogena, vilket begränsar storleken på antigenet i sådana vacciner.
TaRNA är en typ av saRNA där den virala sekvensen, nsPs och genen av intresse (GOI) är involverade i olika mRNA men fungerar tillsammans. Pirjo Spuul et al. introducerade konceptet med ett transreplikeringssystem för första gången 2011.
Viralt replikas kan vara nrRNA eller saRNA, och mRNA som kodar för GOI benämns trans-replikoner (TR-RNA). För att göra TR-RNA-amplifiering kommer konserverade sekvenselement (5'CSE och 3'CSE) från alfaviruset flankerar GOI, med SGP för alfaviruset uppströms GOI. Utformningen av taRNA tar hänsyn till fördelarna med saRNA och lindrar några av deras nackdelar. I synnerhet undviker fristående replikaser som kodar i en RNA-plattform begränsningarna av GOIs längd och begränsar inte användningen av modifierade nukleotider.
Ytterligare framsteg inom tRNA-teknologi har resulterat i utvecklingen av ett förbättrat tRNA med en adeninrik region i 5' UTR. Dessa reviderade tRNA:er som saknar den subgenomiska promotorn av alfavirus resulterar i ett kortare RNA och en 10-faldig minskning av vaccindosen, utan att påverka in vitro-expressionsnivåerna.
Sammantaget är tRNA-tekniken fortfarande i sin linda, men dess praktiska tillämpningar är lovande. Prekliniska studier av tRNA-vaccin mot influensavirus pågår för närvarande. Bivalenta vacciner mot chikungunya- och Ross River-virus är också under utveckling på detta sätt.
Yaohais Bio-Pharma One-Stop CRDMO-lösning för långkodande RNA