Kuten ei-amplifioituvat mRNA:t, sa-RNA koostuu 5' cap:sta, 5' UTR:stä, ORF-alueesta (avoin lukukehys), 3' UTR:stä ja 3' poly(A)-hännästä. Vaikka saRNA eroaa hyvin ei-amplifioivasta mRNA:sta siinä mielessä, että se sisältää replikaasia koodaavan sekvenssin alavirtaan 5'UTR:sta. Kun koodaavat sekvenssit ylittävät 7000 nukleotidia, virusproteiinit ovat erittäin immunogeenisiä, mikä rajoittaa antigeenin kokoa tällaisissa rokotteissa.
TaRNA on eräänlainen saRNA, jossa virussekvenssi, nsP:t ja mielenkiinnon kohteena oleva geeni (GOI) ovat mukana eri mRNA:issa, mutta toimivat yhdessä. Pirjo Spuul ym. esitteli transreplikointijärjestelmän käsitteen ensimmäistä kertaa vuonna 2011.
Viruksen replikaasi voi olla nrRNA tai saRNA, ja GOI:ita koodaavia mRNA:ita kutsutaan trans-replikoneiksi (TR-RNA:iksi). TR-RNA:n monistamisen aikaansaamiseksi konservoituneet sekvenssielementit (5'CSE ja 3'CSE) tulevat GOI:n vieressä olevasta alfaviruksesta, ja alfaviruksen SGP on GOI:sta ylävirtaan. TaRNA:n suunnittelussa otetaan huomioon saRNA:iden edut ja lievitetään joitain niiden haittoja. Erityisesti RNA-alustalla koodaavat erilliset replikaasit välttävät GOI:iden pituuden rajoitukset eivätkä rajoita modifioitujen nukleotidien käyttöä.
Further advances in taRNA technology have resulted in the development of an improved taRNA with an adenine-rich region in the 5' UTR. This revised taRNA’s lacking the subgenomic promoter of alphaviruses results in a shorter RNA and a 10-fold decrease in vaccine dose, without affecting in vitro expression levels.
Overall, taRNA technology is still in its infancy, but its practical applications are promising. Preclinical studies of taRNA vaccines against influenza viruses are currently underway. Bivalent vaccines against chikungunya and Ross River viruses are also under development in this way.
Yaohain Bio-Pharma One-Stop CRDMO-ratkaisu pitkälle koodaavalle RNA:lle