Kuten ei-amplifioivissa mRNAs, sa-RNA koostuu 5' kapista, 5' UTR:stä, ORF-alueesta (avoin lukukoodi), 3' UTR:stä ja 3' poly(A) hännästä. Vaikka saRNA eroaa merkittävästi ei-amplifioivasta mRNA:sta siinä, että se sisältää replikaasikoodijonon 5'UTR:n alapuolella. Kun koodausjonojen pituus ylittää 7000 nukleotidia, virusten proteiinit ovat erittäin immunogeenisiä, mikä rajoittaa antigenin kokoa tällaisissa rokoteissa.
TaRNA on saRNA:n tyyppi, jossa virusten sekvenssi, nsPs ja kiinnostava geeni (GOI) osallistuvat eri mRNAs:iin mutta toimivat yhdessä. Pirjo Spuul et al. esittivät trans-replicointijärjestelmän käsitteen ensimmäisen kerran vuonna 2011.
Viraalinen replikasa voi olla nrRNA tai saRNA, ja mRNAt, jotka koodaavat GOI:deksi, nimetään trans-replikoniksi (TR-RNA). TR-RNA:n amplifikaatiota varten säilyttävät jonoelementit (5’CSE ja 3’CSE) alfa-virusin flankissa ovat GOIn ympärillä, ja alfa-virusin alareunapromotori sijaitsee GOIn edessä. taRNA:n suunnittelu ottaa huomioon saRNA:n edut ja helpottaa joitakin niiden haittoja. Erityisesti itsenäiset replikasat, jotka koodataan RNA-alueella, välttävät GOIn pituuden rajoitteet eivätkä rajoita muokattujen nukleotidien käyttöä.
Lisäedistys taRNA-teknologiassa on johtanut parannetun taRNA:n kehittämiseen, jossa on adeniinirikkoinen alue 5' UTR:ssä. Tämä muokattu taRNA, joka ei sisällä alfa-virusien alareunapromotooria, johtaa lyhyempään RNA:han ja 10-kertaiseen vähennystä rokotteen annoksessa ilman vaikutusta in vitro -ilmaisutasoihin.
Yleisesti ottaen taRNA-teknologia on vielä lapsellisessa vaiheessa, mutta sen käytännön sovellukset ovat lupaavia. TaRNA-rokotteiden prekliiniset tutkimukset influenssaviruksia vastaan ovat tällä hetkellä käynnissä. Kavalentteja rokotteita chikungyunna- ja Ross River -viruksia vastaan kehitetään myös tällä tavalla.
Yaohain Bio-Pharma:n yhteensovitettu CRDMO -ratkaisu pitkälle koodaavalle RNA:lle