Net als niet-amplificerende mRNA bestaat sa-RNA uit een 5' cap, een 5' UTR, een ORF (open reading frame) regio, een 3' UTR en een 3' poly(A) staart. Terwijl saRNA echter zeer verschilt van niet-amplificerende mRNA, omdat het de replicase coderende volgorde bevat in de downstream van de 5'UTR. Met coderende volgordes die 7000 nucleotiden overschrijden, zijn virale eiwitten hoogst immuunogen, wat de grootte van het antigen in dergelijke vaccins beperkt.
TaRNA is een type saRNA waarbij de virale sequentie, nsPs en het gen van interesse (GOI) betrokken zijn in verschillende mRNA's maar samen functioneren. Pirjo Spuul et al. introduceerden in 2011 voor het eerst het concept van een trans-replicatie systeem.
Viral replicase kan nrRNA of saRNA zijn, en mRNAs die GOIs coderen worden trans-replicons (TR-RNAs) genoemd. Om TR-RNA-vermenigvuldiging te realiseren, flankeren conservatieve sequentelementen (5'CSE en 3'CSE) van het alphavirus de GOI, met het subgenomicaire promotor van het alphavirus stroomopwaarts van de GOI. De ontwerping van taRNA neemt de voordelen van saRNAs in overweging en verlicht enkele van hun nadelen. In het bijzonder vermijden zelfstandige replicasen die in een RNA-platform zijn gecodeerd, de beperkingen van de lengte van GOIs en beperken ze niet de gebruik van gemodificeerde nucleotiden.
Verdere vooruitgangen in taRNA-technologie hebben resultaat in de ontwikkeling van een verbeterde taRNA met een adenijnrijke regio in de 5' UTR. Deze herziene taRNAs, zonder de subgenomicaire promotor van alphavirussen, resulteren in kortere RNA en een tienvoudige vermindering van de vaccinedosis, zonder invloed op de in vitro expressieniveaus.
In het algemeen is de taRNA-technologie nog in zijn kinderschoenen, maar de praktische toepassingen ervan zijn veelbelovend. Preclinische studies van taRNA-vaccins tegen griepvirussen zijn momenteel aan de gang. Bivalente vaccins tegen chikungunya en Ross River-virussen worden ook op deze manier ontwikkeld.
Yaohai’s Bio-Pharma Al-in-Één CRDMO-oplossing voor Long-Coding RNA