Yaohai Bio-Pharma готовит циркРНК на основе системы PIE (выравнивание экзонов и интронов), которая опирается на функцию самосплайсинга интронов типа I для достижения циклизации РНК. Структура PIE разработана с использованием гена T4 td или гена-предшественника рыбьей тРНК, и ее расположение выглядит следующим образом:
Интрон РНК и фрагмент поддерживающего экзона разделены на две части (5'-концевую и 3'-концевую), при этом 5'-концевая последовательность переносится в хвост целевой последовательности, 3'-концевая последовательность вставляется в переднюю часть. целевую последовательность, и целевую последовательность гена вставляют в середину.
Под катализом GTP структура PIE приводит к циклизации последовательностей, отличных от интронов. В сочетании с разумной стратегией повышения скорости циклизации Yaohai Bio-Pharma может достичь циклизации последовательностей длиной до 4 т.п.н. со скоростью циклизации более 80%.
Рисунок 1. Циркуляция циркРНК in vitro на основе системы PIE.
Подробности об услугах
| Обработка | Дополнительная услуга | Сервис Подробнее | Срок доставки (рабочий день) |
| дизайн и оптимизация последовательности циркРНК | Проектирование и оптимизация последовательностей кодирования | Выравнивание последовательности CDS Оптимизация кодонов CDS | 1 |
| Проектирование и оптимизация некодирующих последовательностей | Дизайн и оптимизация последовательностей интронов и экзонов Разработка и оптимизация гомологичной последовательности плеч Разработка и оптимизация спейсерной последовательности | 1-2 |
Общие стратегии проектирования последовательностей мРНК
| Компоненты CircRNA | Биологические функции | Стратегии оптимизации |
| Двухконцевые последовательности интронов и экзонов | GTP-катализируемый самосплайсинг интрона для циклизации последовательностей вне интрона. | Разработан на основе гена T4 td или гена-предшественника тРНК рыбьего жира. |
| Кодирование | ИРЭС | Внутренний сайт узнавания рибосомы, регулирующий трансляцию циркРНК. | Скрининг последовательностей внутреннего сайта входа рибосомы (IRES) из различных вирусных источников, например источников EMCV, CVB3. |
| CDS | Белкокодирующие области, последовательности, кодирующие антигены, антитела или другие функциональные белки. | Оптимизация кодонов повышает уровень трансляции; некоторые неоптимальные кодоны могут играть роль в сворачивании белка. |
| Некодирование | Некодирующие последовательности | Нацеливайтесь на микроРНК или белки для осуществления регуляции генов или белков. | Нацеливание на специфические сайты связывания микроРНК или белков может повторять последовательности сайта связывания. |
Наши функции
- Оптимизированная система циклизации PIE Сочетание с разумными стратегиями оптимизации для достижения уровня циклизации более 80%;
- Передовая группа по оптимизации CDS. Сотрудничество с профессиональной командой алгоритмов искусственного интеллекта для завершения оптимизации кодонов региона CDS;
- Зрелый и совершенный процесс циркРНК может быть достигнут с высокой эффективностью циклизации, высокой стабильностью и высокой эффективностью трансляции.
Пример
Yaohai Bio-Pharma выпустила контрольный продукт, усиленный зеленым флуоресцентным белком (eGFP) circRNA, который основан на системе PIE для достижения циклизации РНК.
Используя обычный реагент для трансфекции, циркРНК eGFP трансфицируется в клетки 293T, и флуоресцентный сигнал eGFP (зеленый) может быть обнаружен через 24 часа, который будет усиливаться через 48 часов. Флуоресцентный сигнал все еще можно обнаружить на 7-й день и 14-й день после трансфекция.
Проверка экспрессии in vitro циркРНК eGFP
EN
AR
HR
CS
DA
NL
FI
FR
DE
EL
IT
JA
KO
НЕТ
PL
PT
RO
RU
ES
SV
IW
ID
LV
LT
SR
SK
SL
UK
VI
ET
HU
TH
TR
FA
AF
MS
BE
MK
UR
BN
