Po osrednji dogmi je messenger RNA (mRNA) most za prenos genetskega materiala iz DNK na proteine.
mRNA igra biološko vlogo s kodiranjem proteinov in vivo, zrela mRNA v evkariontskih organizmih pa je sestavljena iz petih komponent: 5' Cap (struktura kapice), 5' UTR (nekodirajoče območje), ORF (odprt bralni okvir), 3' UTR in 3' poliA rep (poliadenilatni rep).
Proces | Izbirna storitev | Podrobnosti o storitvi | Dobavni rok (dan) |
Oblikovanje in optimizacija zaporedja mRNA | Oblikovanje in optimizacija kodirnih sekvenc |
Poravnava zaporedja CDS Optimizacija CDS kodona |
1 |
Oblikovanje in optimizacija nekodirajočih zaporedij |
Oblikovanje in optimizacija zaporedja 5' UTR Oblikovanje in optimizacija zaporedja 3' UTR oblikovanje in optimizacija zaporedja polyA |
1-2 |
5' UTR/3' UTR |
|
3' PolyA rep |
|
Komponente mRNA | Biološke funkcije | Optimizacijske strategije |
5' Cap | Zaščiti mRNA pred razgradnjo z eksonukleazami in deluje usklajeno s poliA repom na 3' koncu, poliA vezavnim proteinom in proteinom faktorja iniciacije prevajanja, da sproži prevajanje proteina. | Naravna struktura Cap1 se izogiba receptorjem za prepoznavanje vzorcev in tako zmanjša naravni imunski odziv, kar je mogoče doseči z enostopenjskim kotranskripcijskim omejevanjem ali dvostopenjskim encimskim omejevanjem [za podrobnosti glejte encimsko omejevanje mRNA in sotranskripcijsko omejevanje]. |
5' UTR | 5' UTR lahko prepoznajo ribosomi, uravnava prevajanje mRNA in vpliva na stabilnost mRNA. | Vsebujejo Kozakova zaporedja brez zelo stabilne sekundarne strukture. Za in vitro transkripcijske (IVT) mRNA, kot sta α-globin in β-globin, so prednostni naravni UTR-ji visoko izraženih genov. |
CDS | Regije, ki kodirajo proteine, in kodirne sekvence za antigene, protitelesa ali druge funkcionalne proteine. | Optimizacija kodona poveča stopnjo prevajanja, pri čemer je treba upoštevati, da lahko nekateri neoptimalni kodoni igrajo vlogo pri zvijanju beljakovin. |
3' UTR | Uravnava prevajanje in stabilnost mRNA. | Za IVT mRNA, kot sta α-globin in β-globin, so prednostni naravni UTR-ji visoko izraženih genov. |
3' polyA rep | Uravnava izražanje beljakovin in ščiti strukturo kapice pred razgradnjo. | Zahtevana je ustrezna dolžina (100-150 bp); kodiranje poliA repa na plazmidu transkripcijske predloge zagotavlja bolj definirano dolžino repa poliA. |
Več virov visoko izraženih naravnih in spremenjenih knjižnic UTR; zrela strategija spreminjanja UTR;
Sodelujte s strokovno ekipo algoritmov AI, da dokončate optimizacijo kodonov.
Za natančnejši nadzor dolžine mRNA dodajte zaporedja poliA glede na predloge DNK.
Doseči učinkovito izražanje mRNA z nizko imunogenostjo.
Zasnova zaporedja dvojne reporterske mRNA: mRNA mCherry-eGFP
Storitev mRNA podjetja Yaohai Bio-Pharma še naprej nadgrajuje z zasnovo in optimizacijo tandemskega zaporedja dvojnega reporterskega gena, ki dosega soizražanje dvojnih genov.
Z uporabo običajnega transfekcijskega reagenta se dvojno gensko tandemsko zaporedje mCherry-eGFP mRNA transfecira v celice 293T in dva fluorescentna signala mCherry (rdeč) in izboljšanega zelenega fluorescentnega proteina (eGFP) se zaznata s hkratno ekspresijo po 48 urah in zloženi graf je označen z rumeno.
Izražanje mRNA mCherry-eGFP v celici 293T