Po osnovni domnevi je posrednik RNA (mRNA) most med prenosom genetskega materiala iz DNA v proteine.
mRNA opravlja biološko vlogo s kodiranjem proteinov v živih organizmih, pri čemer sozrelo mRNA pri eukariotskih organizmih sestoji iz pet komponent: 5' Cap (kap struktura), 5' UTR (nekodiran regij), ORF (odprti berljivi okvir), 3' UTR in 3' poliA rep (poliadenilatni rep).
Proces | Izbirne storitve | Podrobnosti storitev | Dobavni rok (dan) |
načrtovanje in optimizacija mRNA zaporedij | Načrtovanje in optimizacija kodirnih zaporedij |
Poravnava CDS sekvence Optimizacija kodonske CDS sekvence |
1 |
Dizajn in optimizacija nekodirujočih zaporedij |
dizajn in optimizacija zaporedja 5' UTR dizajn in optimizacija zaporedja 3' UTR dizajn in optimizacija zaporedja polyA |
1-2 |
5' UTR/3' UTR |
|
3' PolyA rep |
|
komponente mRNA | Biološke funkcije | Strategije optimizacije |
5' kapa | Varuje mRNA pred degradacijo s strani exonukleaz in deluje skupaj z poliA repom na 3' endi, poliA vezujočim белkom in belkom začetnega prevajanja za zagon prevajanja proteina. | Prirodna Cap1 struktura izogiba vzorcevna razpoznavna receptora in tako zmanjša naravno imunsko odziv, kar se lahko doseže z enim korakom kotranskripcijskega kapiranja ali z dvema korakoma enzimatičnega kapiranja [za več informacij glejte enzimatično kapiranje mRNA in kotranskripcijsko kapiranje]. |
5' UTR | 5' UTR se lahko poveže z ribozomi, regulira prevajanje mRNA in vpliva na stabilnost mRNA. | Vsebujejo Kozakovske sekvence brez zelo stabilne sekundarne strukture. Priročni UTR-ji visoko izraženih genov so priljubljeni za transkripcijo in vitro (IVT) mRNA, kot so α-globin in β-globin. |
CDS | Regije kodiranja beljakovin in kodirane sekvence za antigene, cedilke ali druge funkcionalne beljakovine. | Optimizacija kodonov poveča stopnjo prevoda, opazimo pa, da določeni neoptimalni kodoni lahko igrajo vlogo v zlaganju beljakovin. |
3' UTR | Upravljajo prevod mRNA in stabilnost. | Priročni UTR-ji visoko izraženih genov so priljubljeni za IVT mRNA, kot so α-globin in β-globin. |
3' poliA rep | Upravljajo izraz beljakovin in ščitijo kapično strukturo pred razgradnjo. | Zahtevana je primerena dolžina (100-150 bp); kodiranje polyA repa na plazmidu transkripske šablone omogoči bolj določeno dolžino polyA repa. |
Večkratni viri visoko izraženih naravnih in spremenjenih UTR knjižnic; zrela strategija spremembe UTR;
Sodeluje s profesionalno ekipo AI algoritmov za dokončno optimizacijo kodonov.
Dodajanje polyA zaporedij glede na DNA predloge, da se bolj natančno nadzira dolžina mRNA.
Doseži učinkovito ekspresijo mRNA z nizko imunogenostjo.
Zasnova zaporedja dvojnega poročila mRNA: mCherry-eGFP mRNA
Storitev mRNA Yaohai Bio-Pharma se vedno posodablja s zasnovanim in optimiziranim zaporedjem dvojnega reporterja gena, ki doseže skupno ekspresijo dveh genov.
Z uporabo običajnega transfekcijevega sredstva se mRNA dvojnega gena v zaporedju mCherry-eGFP transficira v 293T celice, in po 48 urah se zaznamenjata dva fluorescenčna signala, mCherry (rdeč) in poudarjen zeleni fluorescenčni-proteин (eGFP) s hkratno ekspresijo, pri čemer je steklena grafika poudarjena v rumeni barvi.
Ekspresija mRNA mCherry-eGFP v 293T celici