V zvezi z masovnim proizvodnjo mRNA je transkripcija v testu (IVT) učinkovitejša in zrelejša metoda. IVT reakcija uporablja linearno plazmidno DNS, ki vsebuje T7 promotor kot predložek, in je mRNA sintetizirana z nukleozidnimi trifosfatami (NTPs) kot substrati v prisotnosti T7 RNA polimeraze.
Spreminjanje nukleotidov je prelom v raziskovanju mRNA, kjer so nepremenične mRNA molekule prepoznavane s strani intracelularnih senzorjev RNA za aktiviranje predhodnega imunosa. Zaradi razlaganja imunogennosti mRNA v živu in učinkovitosti prevajanja se v procesu IVT običajno uporabljajo določeni vrste spremenjenih NTP-jev, med najpogostejšimi spremenjenimi nukleotidi pa so psiudouridin (Ψ), N1-metil-psiudouridin (N1Ψ) in 5-metilcitozin (5mC).
Diagram reakcije transkripcije v laboratoriju (IVT)
Izbirne storitve |
Podrobnosti storitev |
Doba dostave (delovni dan) |
Transkripcija v testu (IVT) |
IVT, Transkripcija v laboratoriju | 1 |
Spremenjeni nukleotidi (Ψ/N1Ψ/5mC itd.) | ||
Odstranitev DNS predloge (DNase I) | ||
Optimizacija pogojev IVT - izbirno |
Načrtovanje in optimizacija komponent reakcije IVT | 2-5 |
Poboljšanje stabilnosti mRNA in izražanja proteina v vivo.
priprava fragmentov mRNA do 10kb je mogoča.
S optimizacijo pogojev reakcije IVT je hitrost transkripcije do 1:200.
Strog nadzor RNase skozi poskusno okolje in potrošninske material glede učinkovito prepreči degradacijo mRNA.
Trenutni sistem IVT reakcije je približno optimiziran za sintetične sisteme z dolžino okoli 100 nt, ne pa za mRNA poljubne dolžine. Še dlajši zaporedji mRNA so težji za transkripcijo in bolj podvrženi degradaciji.
Za pripravo prilagojenih mRNA zaporedij z dolžino okoli 10 kb je Yaohai Bio-Pharma uspešno pripravila visokokakovostne vzorce s transkripcijo v razmerju 1:135 in je dobila 135 μg počistnih mRNA izdelkov po tem, ko je bil 1 μg linearnega plazmida transkribiran v vitro prek strogega poskusnega načrtovanja, neprekinjene optimizacije pogojev reakcije in strogega nadzora RNase.
identifikacija mRNA (elektroforeza v agarosovem gelu)