alle kategorier
ENEN
circRNA sekvensdesign

circRNA sekvensdesign

Hjem >  IVT RNA  >  Brugerdefineret RNA-syntese  >  Brugerdefineret circRNA syntese  >  circRNA sekvensdesign

IVT RNA

circRNA sekvensdesign

Yaohai Bio-Pharma fremstiller circRNA baseret på PIE-systemet (justering af exoner og introner), som er afhængig af den selvsplejsende funktion af type I-introner for at opnå RNA-cyklisering. PIE-strukturen er designet ved hjælp af T4 td-genet eller fishy tRNA-precursor-genet, og arrangementet er som følger:

RNA-intronen og det understøttende exon-fragment er opdelt i to dele (5'-terminal og 3'-terminal), hvor den 5'-terminale sekvens overføres til halen af ​​målsekvensen, hvor den 3'-terminale sekvens indsættes foran på målsekvens, og målgensekvensen indsættes i midten.

undefined

Under katalyse af GTP fører PIE-strukturen til cyklisering af andre sekvenser end introner. Kombineret med en rimelig forbedringsstrategi for cykliseringshastighed kan Yaohai Bio-Pharma opnå cyklisering af sekvenser op til 4 kb med en cykliseringshastighed på mere end 80%.

undefined

Figur 1. In vitro-cirkulation af circRNA baseret på PIE-systemet

Tjenester detaljer
Proces Valgfri service Service detaljer Leveringsperiode (arbejdsdag)
circRNA sekvensdesign og optimering Design og optimering af kodningssekvenser

CDS-sekvensjustering

CDS codon optimering

 1
Design og optimering af ikke-kodende sekvenser

Intron og exon sekvens design og optimering

Homolog armsekvensdesign og optimering

Spacer sekvens design og optimering

 1-2
Fælles strategier for mRNA-sekvensdesign
CircRNA komponenter Biologiske funktioner Optimeringsstrategier
To-terminale intron- og exonsekvenser GTP-katalyseret intron-selvsplejsning til ringslutning af sekvenser uden for intronen. Designet i henhold til T4 td genet eller fiskeolie tRNA precursor genet.
Kodning IRES Internt ribosomgenkendelsessted, der regulerer translationen af ​​circRNA. Screening af interne ribosomentry site (IRES) sekvenser fra forskellige virale kilder, f.eks. EMCV, CVB3 kilder.
CDS Proteinkodende regioner, sekvenser, der koder for antigener, antistoffer eller andre funktionelle proteiner. Kodonoptimering øger oversættelsesniveauet; visse ikke-optimale kodoner kan spille en rolle i proteinfoldning.
Ikke-kodning Ikke-kodende sekvenser Mål miRNA'er eller proteiner for at udøve gen- eller proteinregulering. Målretning af specifikke bindingssteder for miRNA'er eller proteiner kan gentage sekvenserne af bindingsstedet.
Vores egenskaber
  • Optimeret PIE Cyclization System Kombination med rimelige optimeringsstrategier for at opnå en cyclization rate på mere end 80%;
  • Avanceret CDS-optimeringsteam Samarbejde med professionelt AI-algoritmeteam for at fuldføre optimeringen af ​​CDS-regionkodoner;
  • Moden og perfekt proces circRNA kan opnås med høj ringslutningseffektivitet, høj stabilitet og høj translationseffektivitet.
Case study

Yaohai Bio-Pharma lancerede kontrolproduktet forstærket grønt fluorescerende protein (eGFP) circRNA, som er baseret på PIE-systemet for at opnå cyklisering af RNA.

Ved hjælp af et konventionelt transfektionsreagens transficeres eGFP circRNA ind i 293T-celler, og eGFP (grønt) fluorescerende signal kan detekteres efter 24 timer, hvilket vil blive forstærket efter 48 timer. Det fluorescerende signal kan stadig detekteres på den 7. dag og den 14. dag efter transfektion.

图片

In vitro ekspressionsvalidering af eGFP circRNA

Få et gratis tilbud

Kontakt os