sve kategorije
Dizajn sekvence mRNA

Dizajn sekvence mRNA

Prema središnjoj dogmi, glasnička RNA (mRNA) je most za prijenos genetskog materijala od DNA do proteina.

mRNA ima biološku ulogu kodiranjem proteina in vivo, a zrela mRNA u eukariotskim organizmima sastoji se od pet komponenti: 5' Cap (struktura poklopca), 5' UTR (nekodirajuća regija), ORF (otvoreni okvir za čitanje), 3' UTR i 3' poliA rep (poliadenilatni rep).

nedefiniran

Pojedinosti o uslugama
ProcesDodatna uslugaPojedinosti uslugeRazdoblje isporuke (dan)
Dizajn i optimizacija sekvenci mRNADizajn i optimizacija sekvenci kodiranja

CDS slijed poravnanja

Optimizacija CDS kodona

1
Dizajn i optimizacija nekodirajućih sekvenci

Dizajn i optimizacija 5' UTR sekvence

Dizajn i optimizacija 3' UTR sekvence

poliA sekvencijski dizajn i optimizacija

1-2
Opcije koje se mogu prilagoditi
5' UTR/3' UTR
  • Priroda UTR sekvenca
  • Mutant/projektovana UTR sekvenca
3' PoliA rep
  • 100A ~120A rep (preporučeno)
  • Segmentirani poliA rep
  • Drugi prilagođeni rep
Uobičajene strategije za dizajn sekvenci mRNA
Komponente mRNABiološke funkcijeStrategije optimizacije
5' CapZaštitite mRNA od razgradnje egzonukleazama i djelujte zajedno s poliA repom na 3' kraju, poliA veznim proteinom i proteinom faktora inicijacije translacije za iniciranje translacije proteina.Prirodna struktura Cap1 izbjegava receptore za prepoznavanje uzoraka i tako smanjuje prirodni imunološki odgovor, što se može postići ko-transkripcijskim zatvaranjem u jednom koraku ili enzimskim ograničavanjem u dva koraka [pogledajte mRNA enzimatsko ograničavanje i kotranskripcijsko ograničavanje za detalje].
5' UTR5' UTR mogu prepoznati ribosomi, regulirati translaciju mRNA i utjecati na stabilnost mRNA.Sadrže Kozakove sekvence bez vrlo stabilne sekundarne strukture. Prirodni UTR-ovi visoko izraženih gena poželjni su za in vitro transkripciju (IVT) mRNA kao što su α-globin i β-globin.
CDSRegije koje kodiraju proteine ​​i kodirajuće sekvence za antigene, antitijela ili druge funkcionalne proteine.Optimizacija kodona povećava razinu translacije, uz napomenu da određeni neoptimalni kodoni mogu igrati ulogu u savijanju proteina.
3' UTRRegulirajte translaciju i stabilnost mRNA.Prirodni UTR-ovi visoko izraženih gena poželjni su za IVT mRNA kao što su α-globin i β-globin.
3' poliA repRegulirajte ekspresiju proteina i zaštitite strukturu poklopca od degradacije.Potrebna je odgovarajuća duljina (100-150 bp); kodiranje polyA repa na transkripcijskom uzorku plazmida osigurava definiraniju duljinu poliA repa.
Naše značajke
  • Raznovrsni izbor UTR izvora

Višestruki izvori visoko izraženih prirodnih i modificiranih UTR biblioteka; zrela strategija modifikacije UTR-a;

  • Vrhunski CDS tim za optimizaciju

Surađujte s profesionalnim timom za algoritme umjetne inteligencije kako biste dovršili optimizaciju kodona.

  • Ravnomjerna distribucija poliA repa

Dodajte poliA sekvence prema DNK predlošcima kako biste preciznije kontrolirali duljinu mRNA.

  • Raznovrsne kombinacije optimizacije

Postignite učinkovitu ekspresiju mRNA s niskom imunogenošću.

Case study

Dizajn sekvence dvostruke reporterske mRNA: mCherry-eGFP mRNA

Usluga mRNA tvrtke Yaohai Bio-Pharma nastavlja se nadograđivati ​​dizajnom i optimizacijom tandemske sekvence dvostrukog reporterskog gena, čime se postiže koekspresija dualnih gena.

Upotrebom konvencionalnog transfekcijskog reagensa, dvostruka genska tandemska sekvenca mCherry-eGFP mRNA se transfektira u 293T stanice, a dva fluorescentna signala mCherry (crveni) i pojačanog zelenog fluorescentnog proteina (eGFP) otkrivaju se istovremenom ekspresijom nakon 48 sati, a naslagani grafikon je označen žutom bojom.

图片

图片

Ekspresija mCherry-eGFP mRNA u 293T stanici

Dobijte besplatan natječaj

Uzmite u kontaktu