U usporedbi s enzimskim zatvaranjem u dva koraka, metoda kotranskripcijskog zatvaranja u jednom koraku može značajno smanjiti tijek procesa. Metoda je usmjerena na rezultate i uključuje dodavanje cap analoga reakciji in vitro transkripcije (IVT). Cap analozi mogu se uvesti na početku transkripcije, a mRNA s cap strukturom može se dobiti nakon završetka transkripcije. Trenutačni cap analozi treće generacije mogu izbjeći obrnuto ograničavanje i izravno dodati Cap 1 strukturu proizvodu transkripcije.
Za razmatranje imunogenosti mRNA in vivo i učinkovitosti prevođenja, IVT proces često usvaja određene vrste modificiranih NTP-ova, a uobičajeni modificirani nukleotidi su pseudouridin (Ψ), N1-metil-pseudouri-din (N1Ψ) i 5-metilcitozin (5mC) .
Slika: Dijagram mRNA ko-transkripcije i reakcije zatvaranja
Servis | Pojedinosti usluge | Razdoblje isporuke (radni dan) |
Kotranskripcijsko ograničenje | In vitro transkripcijski odgovor (Clean Cap analog) | 1-2 |
Nukleotidne modifikacije (Ψ/N1Ψ/5mC) | ||
Uklanjanje DNK predloška (DNase I) | ||
Optimizacija uvjeta IVT - opcija | Projektiranje i optimizacija reakcijskih komponenti | 3-7 |
Višestruke izborne strategije modifikacije nukleotida mogu poboljšati ekspresiju proteina.
Postignite visok omjer transkripcije i visoku učinkovitost zatvaranja.
Postignite stopu ograničenja veću od 95%.
Učinkovito spriječite degradaciju mRNA strogom kontrolom RNaze u eksperimentalnom okruženju i potrošnom materijalu.
Yaohai Bio-Pharma izgradila je zrelu platformu procesa ko-transkripcijskog zatvaranja, koristeći čiste analogne poklopce za izravno dodavanje strukture Cap1 uz izbjegavanje obrnutog zatvaranja. Nakon standardizirane prethodne obrade uzorka i detekcije kapilarnom elektroforezom (CE), stopa zatvaranja mRNA poboljšanog zelenog fluorescentnog proteina (eGFP) može doseći više od 95%.
Učinkovitost zatvaranja eGFP mRNA veća od 95%
eGFP mRNA i mCherry mRNA pripremljene ko-transkripcijskim zatvaranjem transficirane su u 293T stanice, respektivno, a jak fluorescentni signal opažen je nakon 48 sati, što sugerira da se mRNA učinkovito eksprimira u 293T stanicama.
Ekspresija eGFP mRNA i mCherry mRNA u 293T stanici