Samoopćujući mRNA (saRNA), također poznat kao replikonski RNA, kodira sekvence in vitro transkripcije (IVT) mRNA i virske genove replicaze izvedene od alfavirusa ili flavivirusa. Virski genovi replicaze omogućuju samoopupčivanje mRNA, što rezultira povećanom ekspresijom proteina i minimalnom potrebnom dozom RNA u usporedbi s nepopupčujućim mRNA-ovima. Osim toga, saRNA je relativno velika molekula (više od 14 kb).
Yaohai Bio-Pharma je razvila seriju tehnologija za sintezu mRNA-a kako bi pružila nepopupčujući mRNA i samoopupčujući mRNA (1000 nt~14000 nt), poput dizajna i optimizacije sekvenci, IVT, čišćenja, liofilizacije i encapsulacije lipidnim nanoparticulama (LNP). Sva proizvodstva su oslobodjena pod strogo kontroliranim kvalitetnim standardima.
Slika 1. Strukturne značajke IVT mRNA-ova: Konvencionalni, Krugli i Samoopćujući mRNA.
Samoopčivajući RNA se sastoji od četiri ne-strukturna proteina (označena kao nsP1, nsP2, nsP3 i nsP4), koji su izvedeni iz alfavirusa, posebno iz venezuelskog konjeg encefalitisnog virusa (VEEV). Među njima, nsP1 izražava dvostruku enzimsku aktivnost, a to su GTaza i N7MTaza, dok nsP2 posjeduje RTPaznu aktivnost, ključnu za stvaranje Cap 0 strukture prilikom zaklapanja IVT mRNA. Također, nsP2 djeluje kao proteaza i helikaza, što olakšava složeno obradivanje cjelokupnog nsP kompleksa. Tačna funkcija nsP3 još uvijek nije potpuno razumljiva, ali se uključuje u interakcije s različitim proteinićima domaće stanice, doprinoseći smanjenju antiviralne odgovore domaće stanice.
Regija podgenomskog promotor-a (SGP) alfavirusa nalazi se prije gena od interesa (GOI). SGP element omogućuje pokretanje transkripcije GOI preskačući čitanje niza koji kodira virusske nsP proteine.
Slika 2. Sinteza i celulare asese eGFP saRNA na platformi RNASci Yaohai Bio-Pharma.
Protokol sinteze saRNA je sličan onom za mRNA: Prilagođena sinteza mRNA