Dane mapowania peptydów oparte na chromatografii cieczowej i spektrometrii mas (LC-MS) dostarczą dużej ilości informacji na temat struktury pierwotnej i wyższego rzędu białek natywnych i rekombinowanych, w tym pokrycia sekwencji aminokwasów, modyfikacji potranslacyjnych (PTM, np. glikozylacja , utlenianie, deamidowanie), wiązania dwusiarczkowe itp.
Yaohai Bio-Pharma oferuje usługi analizy mapowania peptydów dla docelowego białka za pomocą LC-MS, aby przyspieszyć badania struktury białka.
Braliśmy udział w charakteryzacji strukturalnej białek różnych dużych cząsteczek, w tym rekombinowanych szczepionek podjednostkowych, nanociał/VHH/przeciwciał jednodomenowych (sdAbs), fragmentów przeciwciał, hormonów/peptydów, cytokin, czynników wzrostu (GF), enzymów, kolagenów, itp.
Wymagania regulacyjne dotyczące mapowania peptydów
Wytyczne ICHQ6B zalecają: „Selektywną fragmentację produktu na odrębne peptydy przeprowadza się przy użyciu odpowiednich enzymów lub substancji chemicznych, a powstałe fragmenty peptydowe analizuje się metodą HPLC lub inną odpowiednią procedurą analityczną. Fragmenty peptydowe należy w miarę możliwości identyfikować przy użyciu technik takich jak analiza składu aminokwasów, sekwencjonowanie N-końca lub spektrometria mas (MS). Mapowanie peptydów substancji czynnej lub produktu leczniczego (DP) przy użyciu odpowiednio zwalidowanej metody jest metodą często stosowaną w celu potwierdzenia pożądanej struktury produktu do zwolnienia serii.”
Metody analityczne
Analiza |
Metody |
Mapowanie peptydów |
Trawienie proteazami i chromatografia cieczowa-spektrometria mas (LC-MS) |
Procedura analityczna
1. Redukcja i alkilowanie
Celem jest redukcja mostków dwusiarczkowych i zablokowanie wytworzonego wolnego tiolu. Redukcja mostków dwusiarczkowych pomaga otworzyć strukturę białka, co sprawia, że trawienie proteolityczne jest bardziej efektywne. Ten etap spowoduje również przerwanie mostków między łańcuchami w przypadku białek wielołańcuchowych, które mają mostki dwusiarczkowe łączące łańcuchy (np. przeciwciała monoklonalne, mAb).
2. Trawienie białka za pomocą enzymów
Celem jest rozbicie białka na peptydy. Enzymy wybraliśmy w oparciu o teoretyczną sekwencję białka i wiedzę na temat teoretycznego trawienia białka przez enzymy. Wybierając w ten sposób enzymy, powinniśmy uzyskać najlepszą analizę mapowania peptydów.
3. Analiza strawionych peptydów Wysokosprawna chromatografia cieczowa z odwróconą fazą on-line z ultrafioletem (UV) i detekcją spektrometrią mas przez elektrorozpylanie (LC/ES-MS).
Separacja peptydów na podstawie polarności przy użyciu LC (LC z odwróconą fazą)
Gdy peptyd eluuje się z kolumny LC, spektrometr mas wygeneruje informację o masie wraz z informacją o jonach fragmentacyjnych, co umożliwi nam określenie informacji o sekwencji. Informacje o sekwencji wykorzystujemy do potwierdzenia tożsamości peptydu i dostarczenia podstawowych informacji.
Możemy również wygenerować informacje o fragmentacji z peptydów wchodzących do źródła spektrometru mas z kolumny LC. W zależności od wymagań badania jest to albo selektywna LC-MS/MS, albo nieselektywna, co można uznać za formę tandemowego MS.