A folyékony kromatográfia-tömegspektrometria (LC-MS) alapú peptid térképzési adatok nagy mennyiségű információt biztosítanak az eredeti és rekombináns fehérjék elsődleges és magasabbrendű szerkezetről, beleértve az amino sav sorozat-fedettséget, a poszt-transzlációs módosításokat (PTMs, például: glikoziláció, oxidáció, deamidáció), diszulfídszüneteket, stb.
A Yaohai Bio-Pharma肽 térképzési elemző szolgáltatásokat kínál LC-MS segítségével a célféhérjére vonatkozóan, hogy gyorsítsa elő a kutatásait a fehérjének szerkezetével kapcsolatban.
Részvettünk egyéb nagy molekulák fehérjei szerkezetének jellemzésében, beleértve a Rekombináns Alfejtény Oltásokat, Nan Testek/VHH-k/Egyszerűszerű Antitestek (sdAbs), Antitest Törések, Hormonok/Peptidok, Cytokinok, Növekedési Faktorok (GF), Enzymek, Kollagensek, stb.
Szabályozási követelmények a Peptid Térképezéshez
Az ICHQ6B útmutató ajánlja, hogy „a termék kiválasztott felosztása diszkrét peptidként alkalmas enzimek vagy kémiai anyagok használatával történik, és az eredményül kapott peptidfragmentumokat HPLC-szel vagy más megfelelő analitikai eljárással elemzik. A peptidfragmentumokat akkor is lehet azonosítani, ha lehet, például aminosav-összetégi elemzéssel, N-végeselemes sorozatképzéssel vagy tömegspektrometriával (MS). Az aktív anyag vagy gyógyszer termék (DP) peptid térképe egy alkalmasan validált módszerrel való kidolgozása gyakran használatos a kívánt termékszerkezet megerősítésére a savari kiadáskor.”
Elemző módszerek
Elemzés |
Módszerek |
Peptid térképezés |
Proteázis feldarabolás és folyadék-kromatográfia-tömegspektrometria (LC-MS) |
Analitikai eljárás
1. Redukció és alkiláció
A cél a disszulfid-hídak csökkentése és a létrejött szabad tióhímód blokkolása. A disszulfid-hídak csökkentése segít a fehérjéstruktúra nyitásában, ami nagyobb hatékonyságot eredményez a proteolitikus feldarabolás során. Ez a lépés megsemmisíti a hídot a láncok között a többi láncos fehérjék esetében, amelyeknek disszulfid-hídban összekapcsolt láncai vannak (pl. monoklonális antitestek, mAbs).
2. A fehérjék enzimekkel történő feldarabolása
A cél a fehérjék peptidökbe történő felosztása. Az enzimeket a fehérjének elméleti sorozatára és az enzimek által történő fehérjéfeldarabolásról származó ismeretek alapján választottuk ki. Ezen enzimek kiválasztásával a legjobb peptid térképes elemzést kell elérni.
3. A feldarabolódott peptidök elemzése On-line fordított fázis-HÁGK használatával Ultraviolett (UV) és Elektrospray-Tömegspektrometriai érzékeléssel (LC/ES-MS).
Peptid-elválasztás polaritás alapján LC-n (fordított fázis-LC)
Ahogy a peptid kiszivárgatkozik az LC oszlopról, a tömegspektrométer generál tömegi adatokat és törésvonzony-információkat, amelyek lehetővé teszik számunkra, hogy meghatározzuk a sorozati információkat. A sorozati információkat használjuk a peptid azonosításának megerősítésére és elsődleges információk biztosítására.
Továbbá a törésvonzony-információkat is generálhatjuk a peptidből, amikor az az LC oszlop róla a tömegspektrométer forrásába lép. A tanulmány követelményeitől függően ez vagy selektív LC-MS/MS, vagy nem selektív, ami egyfajta tandems MS-ként tekinthető.