Стратегии оптимизации кодонов

Существует 64 генетических кодона, из которых 60 кодируют 20 аминокислот. Каждый организм, используемый для экспрессии или производства белка (включая Escherichia coli, дрожжи, клетки млекопитающих, Pichia, растительные клетки и клетки насекомых), демонстрирует некоторую степень различия или предпочтения в использовании кодонов. Кодоны, наиболее часто используемые в хозяине, называются оптимальными кодонами, в то время как те, которые используются нечасто, называются редкими или малоиспользуемыми кодонами.

Оптимизация кодонов

Оптимизация кодонов включает в себя изменение последовательности гена путем использования предпочтительных кодонов и избегания малоиспользуемых или редких кодонов, а затем получение измененного гена посредством синтеза генов. Такая переделка генов называется оптимизацией кодонов.

Оптимизированная последовательность гена может повысить стабильность вторичной структуры мРНК, предотвращая задержки трансляции, преждевременное завершение трансляции, сдвиг рамки трансляции и несоответствия аминокислот из-за недостаточного количества пулов тРНК.

Оптимизация важна, поскольку она способствует эффективному протеканию таких процессов, как синтез генов, конструирование векторов, транскрипция и трансляция.

Факторы оптимизации

Балансировка содержания GC: Это влияет на стабильность связывания, температуру отжига и выход белка.

Сокращение повторяющихся последовательностей: Это снижает сложность синтеза генов.

Корректировка вторичной структуры мРНК: Чтобы избежать шпильковых структур, влияющих на перевод.

Устранение участков разрезания ферментами рестрикции: Для защиты целостности гена.

Предпочтение кодона: Оптимизация донорского гена в соответствии с хозяином для максимизации экспрессии белка.

Поддержка Яохай

Для проектирования и синтеза генов недостаточно просто экспрессии белка и оптимизации кодонов. Различные методы и программы могут проектировать и производить различные оптимизированные по кодонам последовательности мРНК. На основе вышеуказанных факторов оптимизации, в сочетании с официальной базой данных и обобщения многолетнего опыта синтеза генов, Yaohai Bio-Pharma разработала свою уникальную базу данных оптимизации кодонов. Она может предоставить вам бесплатную оптимизацию кодонов и схему синтеза генов для максимизации оптимизации кодонов вашей последовательности генов.

Компания Yaohai Bio-Pharma разработала полный набор технологий синтеза линейной и кольцевой мРНК для получения высококачественной РНК, включая проектирование и оптимизацию последовательности, синтез генов, IVT, кольцевание, очистку РНК и инкапсуляцию LNP.

Мы также активно ищем институциональных или индивидуальных глобальных партнеров. Мы предлагаем самую конкурентоспособную компенсацию в отрасли. Если у вас есть какие-либо вопросы, пожалуйста, свяжитесь с нами: [email protected]

Более подробную информацию о компании Yaohai Bio-Pharma можно найти на нашем сайте: www.yaohaibio-pharma.com