Стратегии оптимизации кодонов

Существует 64 генетических кодона, из которых 60 кодируют 20 аминокислот. Каждый организм, используемый для экспрессии или производства белка (включая Escherichia coli, дрожжи, млекопитающие клетки, Pichia, растительные клетки и насекомые клетки), проявляет определенную степень различия или предпочтения в использовании кодонов. Наиболее часто используемые кодоны в хозяине называются оптимальными кодонами, тогда как малоиспользуемые называются редкими или низкоиспользуемыми кодонами.

Оптимизация кодонов

Оптимизация кодонов включает модификацию генной последовательности за счет использования предпочтительных кодонов и избегания малоиспользуемых или редких кодонов, после чего получают модифицированный ген через синтез гена. Такое переформатирование генов называется оптимизацией кодонов.

Оптимизированная генная последовательность может улучшить стабильность вторичной структуры мРНК, предотвращая задержки трансляции, преждевременное прекращение трансляции, сдвиг рамки чтения и несоответствие аминокислот из-за недостаточных пулов тРНК.

Оптимизация имеет большое значение, поскольку она способствует эффективному продвижению процессов, таких как синтез генов, конструирование векторов, транскрипция и перевод.

Факторы оптимизации

Выравнивание содержания GC: Это влияет на устойчивость связывания, температуру спаривания и выход белка.

Сокращение повторяющихся последовательностей: Это снижает сложность синтеза генов.

Корректировка вторичной структуры mRNA: Чтобы избежать петлеобразных структур, которые влияют на перевод.

Устранение мест расщепления рестрикционными эндонуклеазами : Для защиты целостности гена.

Предпочтение кодонов: Оптимизация донорского гена в соответствии с хозяином для максимизации экспрессии белка.

Поддержка Yaohai

Для проектирования и синтеза генов простой экспрессии белка и оптимизации кодонов недостаточно. Различные методы и программы могут проектировать и производить различные оптимизированные последовательности мРНК с кодонами. На основе вышеуказанных факторов оптимизации, в сочетании с официальной базой данных и подведением итогов многолетнего опыта синтеза генов, компания Yaohai Bio-Pharma разработала свою уникальную базу данных оптимизации кодонов. Она может предоставить вам бесплатную оптимизацию кодонов и разработку схемы синтеза генов для максимальной оптимизации вашей генной последовательности.

Компания Yaohai Bio-Pharma создала полный набор технологий синтеза линейной мРНК и циркулярной мРНК для предоставления высококачественной РНК, такой как проектирование и оптимизация последовательностей, синтез генов, ВТК, циклизация, очистка РНК и оболочка ЛНП.

Мы также активно ищем глобальных партнеров среди организаций или частных лиц. Мы предлагаем самое конкурентоспособное вознаграждение в отрасли. Если у вас есть вопросы, не стесняйтесь обращаться к нам: [email protected]

Для получения дополнительной информации о Yaohai Bio-Pharma, пожалуйста, посетите наш сайт: www.yaohaibio-pharma.com