Visas kategorijas
In vitro transkripcija un cirkulācija

In vitro transkripcija un cirkulācija

Sākums >  IVT RNS  >  Pielāgota RNS sintēze  >  Pielāgota cirRNS sintēze  >  In vitro transkripcija un cirkulācija

In vitro transkripcija un cirkulācija

Attiecībā uz RNS prekursoru sērijveida sagatavošanu parasti izmantotā metode ir in vitro transkripcija (IVT). IVT reakcijā kā veidni izmanto linearizētu plazmīdas DNS, kas satur T7 promotoru, un sintezē RNS prekursoru ar nukleozīdu trifosfātiem (NTP) kā substrātu T7 RNS polimerāzes klātbūtnē.

In vitro ciklizācijas metodes ietver ķīmisko ligāciju, fermentatīvo ligāciju un permutētā intron-eksona (PIE) metodi. Īsāku RNS ciklizācijai ir piemērota ķīmiskā ligācija un fermentatīvā ligācija. Ja fragments ir lielāks par 100 nt, ciklizācijas ātrums ievērojami samazināsies. Turpretim nukleāzes metode, kuras pamatā ir PIE sistēma, var panākt 8 kb sekvenču ciklizāciju.

Guanozīna trifosfāta (GTP) katalīzes rezultātā PIE struktūrā notiek ekstraintronu sekvenču ciklizācija. Apvienojumā ar saprātīgu stratēģiju, lai palielinātu ciklizācijas ātrumu, Yaohai Bio-Pharma var sasniegt ciklizāciju līdz pat 4 kb sekvencēm ar ciklizācijas efektivitāti, kas pārsniedz 80%.

undefined

RNS ciklizācijas reakcija in vitro notiek šādi:

RNS prekursors tiek sintezēts ar in vitro transkripciju, un PIE komponents pabeidz pašsavienošanos GTP katalīzes laikā, veidojot cirRNS.

undefined

Informācija par pakalpojumiem
ProcessInformācija par pakalpojumuPiegādes periods (darba diena)
In vitro transkripcija un cirkulācijaReakcijas sistēmas apstiprinājums1-2
In vitro transkripcijas un ciklizācijas reakcijas
RNāzes R gremošana
Reakcijas optimizācijaReakcijas sastāvs, laika optimizācija2-5
Mūsu funkcijas
    • Stingrs testa dizains un optimizācija

Var sasniegt līdz 4 kb RNS ciklizāciju.

    • Augsta ciklizācijas efektivitāte

Ciklizēšanas ātrumu, kas pārsniedz 80%, var sasniegt, izmantojot racionālu secības optimizācijas stratēģiju.

    • Stingra RNāzes kontrole

Stingri kontrolējot RNāzes eksperimentālajā vidē un palīgmateriālos, RNS degradācija tiek efektīvi novērsta.

Gadījuma izpēte

CirRNS in vitro ciklizācija un bagātināšana

Pamatojoties uz PIE sistēmu, Yaohai Bio-Pharma ir optimizējis cirRNS secību ar ciklizācijas ātrumu, kas pārsniedz 80%, izmantojot agarozes gēla elektroforēzi (AGE). Izmantojot RNase R, lai bagātinātu cirRNS, E-gēla elektroforēzes rezultāti liecina, ka lineārais RNS prekursors tiek sagremots, un pēc turpmākas attīrīšanas lielāko daļu cirRNS var noņemt. Attīrīšanas risinājumu izstrādājis uzņēmums Yaohai Bio-Pharma.

undefined

In vitro cirkulācija un cirRNS bagātināšana

Iegūstiet bezmaksas cenu

Sazināties