Strategije optimizacije kodona

Obstaja 64 genetskih kodonov, od katerih jih 60 kodira 20 aminokislin. Vsak organizem, ki se uporablja za izražanje ali proizvodnjo beljakovin (vključno z Escherichia coli, kvasovkami, celicami sesalcev, Pichia, rastlinskimi celicami in celicami žuželk), kaže določeno stopnjo razlike ali prednosti pri uporabi kodona. Kodoni, ki se najpogosteje uporabljajo v gostitelju, se imenujejo optimalni kodoni, medtem ko se tisti, ki se ne uporabljajo pogosto, imenujejo redki ali redko uporabni kodoni.

Optimizacija kodona

Optimizacija kodona vključuje spreminjanje genskega zaporedja z uporabo prednostnih kodonov in izogibanjem redkim ali redkim kodonom, nato pa pridobivanje spremenjenega gena s sintezo genov. To preoblikovanje genov imenujemo optimizacija kodona.

Optimizirano gensko zaporedje lahko izboljša stabilnost sekundarne strukture mRNA, s čimer prepreči zamude pri prevajanju, prezgodnjo prekinitev prevajanja, premik okvirja pri prevajanju in neujemanja aminokislin zaradi nezadostnih skupin tRNA.

Optimizacija je pomembna, ker olajša učinkovito napredovanje procesov, kot so sinteza genov, konstrukcija vektorjev, prepisovanje in prevajanje.

Faktorji optimizacije

Uravnoteženje vsebine GC: To vpliva na stabilnost vezave, temperaturo žarjenja in izkoristek beljakovin.

Zmanjšanje ponavljajočih se zaporedij: To zmanjša težave pri sintezi genov.

Prilagoditev sekundarne strukture mRNA: Da bi se izognili lasnim strukturam, ki vplivajo na prevod.

Odstranjevanje mest rezanja restrikcijskih encimov: Za zaščito integritete gena.

Prednost kodona: Optimiziranje donorjevega gena glede na gostitelja za čim večjo ekspresijo beljakovin.

Yaohaijeva podpora

Za načrtovanje in sintezo genov samo izražanje beljakovin in optimizacija kodona ne zadostujeta. Različne metode in programi lahko oblikujejo in izdelajo različne sekvence mRNA, optimizirane za kodon. Yaohai Bio-Pharma je na podlagi zgornjih faktorjev optimizacije v kombinaciji s svojo uradno zbirko podatkov in povzetkom let izkušenj s sintezo genov razvila svojo edinstveno zbirko podatkov o optimizaciji kodonov. Zagotovi vam lahko brezplačno optimizacijo kodona in zasnovo sheme za sintezo genov, da povečate optimizacijo kodona zaporedja vaših genov.

Yaohai Bio-Pharma je vzpostavil celoten niz tehnologij za sintezo linearne mRNA in krožne mRNA za zagotavljanje visokokakovostne RNA, kot so zasnova in optimizacija zaporedja, sinteza genov, IVT, cirkularizacija, čiščenje RNA in inkapsulacija LNP.

Aktivno iščemo tudi institucionalne ali individualne globalne partnerje. Ponujamo najbolj konkurenčno nadomestilo v panogi. Če imate kakršna koli vprašanja, nas kontaktirajte: [email protected]

Za več podrobnosti o Yaohai Bio-Pharma obiščite našo spletno stran: www.yaohaibio-pharma.com