Strategije optimizacije kodonov

Obstaja 64 genetskih kodonov, od katerih 60 kodirajo za 20 aminokislin. Vsako organizma, ki se uporablja za izraz ali proizvodnjo proteina (vključno s Escherichia coli, kvasom, sisarskimi celicami, Pichijskimi, rastlinskim celicami in hroščevim celicami), kaže nek sled razlike ali prednosti v uporabi kodonov. Kodoni, ki jih najpogosteje uporablja domači organizem, se imenujejo optimalni kodoni, medtem ko so tisti, ki jih redko uporabljajo, imenovani redki ali malo uporabljani kodoni.

Optimizacija kodonov

Optimizacija kodonov vsebuje spreminjanje genske zaporedje tako, da se uporabljajo priljubljeni kodoni in se izogibajo malo uporabljanim ali redkim kodonom, nato pa se pridobi spremenjeno gen prek sinteze gene. Ta ponovna oblika genov se imenuje optimizacija kodonov.

Optimirano gensko zaporedje lahko poveča stabilnost sekundarne strukture mRNA, preprečuje zamude pri prevajanju, predčasno končanje prevajanja, premik okvirjev prevajanja in neskladnosti aminokislin zaradi nepopolnih zalog tRNA.

Optimizacija je pomembna, ker omogoča učinkovito potezo procesov, kot so sinteza genov, izgradnja vektorjev, transkripcija in prevod.

Faktorji optimizacije

Urejanje GC vsebine: To vpliva na stabilnost vezovanja, temperaturo annealinga in izdelavo proteina.

Zmanjševanje ponavljajočih se zaporedij: To zmanjša težave pri sintezi genov.

Prilagajanje sekundarne strukture mRNA: Da se izognemo kudravim strukturam, ki vplivajo na prevod.

Izbiro omejujočih enzimskih točk rezanja : Da se zaščiti celovitost gene.

Prednost kodonov: Optimiziranje davalcne gene glede na gostitelja za maksimalno izražanje proteina.

Podpora Yaohai

Za dizajn in sintezo gena ni dovolj le izražanja proteina in optimizacije kodonov. Različne metode in programe lahko dizajnujejo in proizvajajo različne kodonsko optimizirane mRNA sekvence. Na osnovi zgoraj omenjenih faktorjev optimizacije, v kombinaciji s svojo uradno bazo podatkov ter zbranimi leti izkušenj v genijski sintezi, je Yaohai Bio-Pharma razvil svoj edinstven bazo podatkov za optimizacijo kodonov. Lahko vam ponudi brezplačno optimizacijo kodonov in dizajn sheme geneske sinteze za maksimalno optimizacijo vase sekvence gena.

Yaohai Bio-Pharma je vzpostavila komplekten sistem tehnologij za sintezo linearnega mRNA in krožnega mRNA, da zagotovi visoko kakovostno RNA, kot so dizajn in optimizacija sekvenc, geneska sinteza, IVT, kroženje, čiščenje RNA in LNP obalovanje.

Prav tako aktivno iščemo globalne partnerje, institucije ali posameznike. Ponujamo največje naknadne plačilo v industriji. Če imate katere koli vprašanja, nas prosimo, da nas svobodno kontaktirate: [email protected]

Za več podrobnosti o Yaohai Bio-Pharma se prosimo obrnite na naš spletni strani: www.yaohaibio-pharma.com