طبق قانون مرکزی، آرآمپی (mRNA) پلی است که مواد ژنتیکی را از DNA به پروتئین‌ها منتقل می‌کند.
آرآمپی نقش زیستی خود را با کدنویسی پروتئین‌ها در بدنه ایفا می‌کند و mRNA ناضج در سازمان‌های یوکاریوت شامل پنج مؤلفه است: سر 5' (ساختار سر)، منطقه UTR 5' (منطقه غیرکدگذار)، ORF (فریم خواندن باز)، UTR 3' و دنباله polyA 3' (دنباله پلی‌آدنیلات).
جزئیات خدمات
| فرآیند |
سرویس اختیاری |
جزئیات خدمات |
مدت زمان تحویل (روز) |
| طراحی و بهینه‌سازی دنباله mRNA |
طراحی و بهینه‌سازی دنباله‌های کدگذاری |
هماهنگی دنباله CDS
بهینه‌سازی کدون CDS
|
1 |
| طراحی و بهینه‌سازی توالی‌های غیر کدگذار |
طراحی و بهینه‌سازی دنباله 5' UTR
طراحی و بهینه‌سازی دنباله 3' UTR
طراحی و بهینه‌سازی دنباله polyA
|
۱-۲ |
گزینه های قابل تنظیم
| نواحی 5' UTR/3' UTR |
- دنباله طبیعی UTR
- دنباله جهش‌یافته / مهندسی شده UTR
|
| دنبالهٔ PolyA 3' |
- دنباله ۱۰۰A تا ۱۲۰A (توصیه شده)
- دنباله پلی A قطعه‌ای
- دنباله سفارشی دیگر
|
روش‌های معمول برای طراحی دنباله mRNA
| مؤلفه‌های mRNA |
توابع زیستی |
روش‌های بهینه‌سازی |
| کاپ 5' |
مRNA را از تخریب توسط اکسونوکلزها محافظت می‌کند و در هماهنگی با دنباله پلی A در انتهای 3'، پروتئین باند کننده پلی A و فاکتور شروع ترجمه پروتئین برای شروع ترجمه پروتئین عمل می‌کند. |
ساختار طبیعی Cap1 از شناسایی الگوی رسانه‌های تشخیص الگو جلوگیری می‌کند و بنابراین واکنش ایمنی طبیعی را کاهش می‌دهد، که می‌تواند از طریق حمله مشترک یک مرحله‌ای یا حمله انزیمی دو مرحله‌ای به دست آید [برای جزئیات به حمله انزیمی mRNA و حمله مشترک مراجعه کنید]. |
| ناحیه 5' UTR |
ناحیه ۵' UTR می‌تواند توسط ریبوزوم‌ها تشخیص داده شود، ترجمه mRNA را تنظیم کند و بر پایداری mRNA تأثیر بگذارد. |
شامل دنباله‌های کوزاک بدون ساختار ثانویه بسیار پایدار هستند. انتخاب UTRهای طبیعی ژن‌های با عبارت بالا برای ترانسکریپشن در محیط غیرزنده (IVT) mRNA مانند آلفا-گلوبین و بتا-گلوبین ترجیح داده می‌شود. |
| CDS |
ناحیه‌های کدنویس پروتئین و دنباله‌های کدنویس برای آنتی‌ژن‌ها، آنتی‌بادی‌ها یا پروتئین‌های عملکردی دیگر. |
بهینه‌سازی کدگذاری سطح ترجمه را افزایش می‌دهد، با توجه به اینکه برخی از کدون‌های غیربهینه ممکن است نقشی در جمع‌آوری پروتئین داشته باشند. |
| uTR ۳' |
تنظیم ترجمه mRNA و پایداری آن را انجام می‌دهد. |
UTRهای طبیعی ژن‌های با عبارت بالا برای IVT mRNA مانند آلفا-گلوبین و بتا-گلوبین ترجیح داده می‌شوند. |
| دنباله ۳' polyA |
برداشت پروتئین را تنظیم می‌کند و ساختار کپ را از تجزیه محافظت می‌کند. |
طول مناسب (100-150 bp) الزامی است؛ قرار دادن دنباله پلی A روی پلاسمید الگوی ترنسکریپش، طول دقیق‌تری برای دنباله پلی A تضمین می‌کند. |
ویژگی‌های ما
منابع متعدد کتابخانه‌های UTR طبیعی و اصلاح شده با بیان بالا؛ راهبرد اصلاح UTR ناضج؛
همکاری با یک تیم الگوریتم هوش مصنوعی حرفه‌ای برای تکمیل بهینه‌سازی کدون‌ها.
افزودن دنباله پلی A بر اساس الگوهای DNA برای کنترل دقیق‌تر طول mRNA.
داستن بیان کارآمد mRNA با ایمونوژنیته کم.
مطالعه موردی
طراحی دنباله دو گزارشگر mRNA: mRNA mCherry-eGFP
سرویس mRNA شرکت یائوهای بیو-فارما با طراحی و بهینه‌سازی دنباله تاندموی دو ژن گزارشگر ادامه یافت که منجر به هم‌برق‌آمدگی دو ژن می‌شود.
استفاده از عامل معمولی تراسفکسیون، دنباله تاندم دو ژن mCherry-eGFP mRNA را در سلول‌های 293T تراسفکت می‌کند و پس از 48 ساعت، دو سیگنال فلوئورسنت mCherry (قرمز) و پروتئین فلوئورسنت سبز تقویت‌شده (eGFP) با برق‌آمدگی همزمان تشخیص داده می‌شوند و نمودار تراکم‌یافته به رنگ زرد نمایش داده می‌شود.
برق‌آمدگی mRNA mCherry-eGFP در سلول 293T
FA
EN
AR
HR
CS
DA
NL
FI
FR
DE
EL
IT
JA
KO
NO
PL
PT
RO
RU
ES
SV
IW
ID
LV
LT
SR
SK
SL
UK
VI
ET
HU
TH
TR
AF
MS
BE
MK
UR
BN
