در مورد تولید جمعی آر ام ان، ترانسکریپشون در محیط بیرون زنده (IVT) روشی کارآمدتر و ناضجتر است. واکنش IVT از دی ان ای پلاسمید خطی حاوی پروموتر T7 به عنوان الگو استفاده میکند و آر ام ان با استفاده از نوکلئوتید سه فسفری (NTPs) به عنوان زیربنه در حضور پلیمراز آر ام ان T7 سنتز میشود.
اصلاح نوکلئوتیدها یک گام بزرگ در کاوش آر ام ان است، که در آن مولکولهای آر ام ان بدون اصلاح توسط حسگرهای آر ام ان داخل سلول تشخیص داده میشوند تا ایمنی ذاتی را فعال کنند. برای در نظر گرفتن ایمنیزا بودن آر ام ان در بدن و کارایی ترجمه، فرآیند IVT معمولاً از نوع خاصی از NTPs اصلاح شده استفاده میکند و نوکلئوتیدهای اصلاح شده معمول شامل یوئیدین افتاده (Ψ)، یوئیدین افتاده متیلشده N1 (N1Ψ) و سیتوزین متیلشده 5 (5mC) است.
نمودار واکنش ترانسکریپشون در محیط بیرون زنده (IVT)
سرویس اختیاری |
جزئیات خدمات |
دوره تحویل (روز کاری) |
ترانسکریپسیون در محیط غیرزنده (IVT) |
IVT، ترنسکریپسیون در محیط بیرونی سلولی | 1 |
تغییرات نوکلئوتیدی (Ψ/N1Ψ/5mC، و غیره) | ||
حذف الگوی DNA (دناز I) | ||
بهینهسازی شرایط IVT - اختیاری |
طراحی و بهینهسازی مولفههای واکنش IVT | 2 تا 5 |
افزایش استقرار mRNA و بیان پروتئین در حیات واقعی.
آمادهسازی قطعه mRNA تا 10 کیلوبیت قابل دسترسی است.
با بهینهسازی شرایط واکنش IVT، نرخ تراگیری تا 1:200 است.
کنترل سختگیرانه RNase از طریق محیط آزمایشگاهی و مصرفیها میتواند جلوگیری مؤثری از تجزیه mRNA انجام دهد.
سیستم واکنش IVT فعلی تقریباً برای سیستمهای سنتزی با طول حدود 100 nt بهینهسازی شده است، نه برای mRNAهایی با طول دلخواه. هرچه طول mRNA بیشتر باشد، تراگیری آن دشوارتر است و عرضه خطر تجزیه بیشتری قرار میگیرد.
برای آمادهسازی توالیهای mRNA سفارشی با طول حدود 10 کیلوبایت، شرکت Yaohai Bio-Pharma با طراحی آزمایشی دقیق، بهینهسازی پیوسته شرایط واکنش و کنترل سختگیرانه RNase، نمونههای کیفیت بالا را با نسبت تراگیری بالای 1:135 آماده کرده و پس از تراگیری درون زیستی 1 میکروگرم پلاسمید خطیشده، 135 میکروگرم محصولات mRNA پاکشده اولیه به دست آورده است.
شناسایی mRNA (الکتروفورز ژل آگاروز)