Keskpunkti järgi on hõimuline RNA (mRNA) ülekandmise mosterina DNA-st proteiinideks.
mRNA mängib bioloogilist rolli, kodeerides proteiine elus organis, ja eukariotsete organismide täisiksmRNA koosneb viiest komponendist: 5' Kap (kappstruktuur), 5' UTR (kodeerimata piirkond), ORF (avatud lugemisraam), 3' UTR ja 3' polyA hääl (polyadeeniline hääl).
Protsess | Valikuline teenus | Teenuste üksikasjad | Toimetamisperiood (päev) |
mRNA jada kujundamine ja optimeerimine | Koodivate jadade kujundamine ja optimeerimine |
CDS jada võrdlemine CDS kodooni optimeerimine |
1 |
Mittekodeerivate jadade kujundamine ja optimeerimine |
5' UTR jada disain ja optimeerimine 3' UTR jada disain ja optimeerimine polyA jada disain ja optimeerimine |
1-2 |
5’ UTR/3’ UTR |
|
3' PolyA saba |
|
mRNA komponendid | Bioloogilised funktsioonid | Optimeerimisstrateegiad |
5' Kap | Kaitseb mRNA eksoneükleasite poolt toimuva hajumast eest ja koostöös polyA sabaga lõpul 3', polyA siduv proteiinide ja tõlgete alguse faktoriproteiinidega käivitab protseini tõlge. | Looduslik Cap1 struktuur vältib möödaparemituste tuvastamise reseptoreid ning nii vähendab loodvat immuunivastut, mis saab teha ühe-sammulise kokkutranskriptsioonilise kapimise või kahe-sammulise enzyymkapimise abil [vaata mRNA enzyymkapimist ja kokkutranskriptsioonilist kapimist detailides]. |
5' UTR | 5' UTR'i võivad ribosoomid tuvastada, määratleda mRNA tõlkimise ja mõjutada mRNA stabiilsust. | Sisaldavad Kozaki jadasid ilma liiga stabiilse sekundaarstruktuurita. Loodud UTR'id kõrgelt ekspresseeritavatest geenidest on eelistatud in vitro transkriptsiooni (IVT) mRNA-de jaoks, nagu α-globiin ja β-globiin. |
CDS | Proteiini-koodivad piirkonnad ja kodeerivad jadased antigeenide, antikehade või teiste funktsionaalsete proteiinide jaoks. | Koodonoptimeerimine suurendab tõlkimise taseme, märkides, et mõned mitte-optimaalsed koodonid võivad mängida rolli proteiini lihtspiraamises. |
3’ UTR | Määratlevad mRNA tõlkimise ja stabiilsuse. | Loodud UTR'id kõrgelt ekspresseeritavatest geenidest on eelistatud IVT mRNA-de jaoks, nagu α-globiin ja β-globiin. |
3’ polyA saba | Määratlevad proteiini ekspresiooni ja kaitsavad kapistruktuuri hajumast. | Piisav pikkus (100-150 bp) on vajalik; transkriptsiooniplaasma polyA-häli kodeerimine tagab täpsema polyA-halli pikkuse. |
Mitmeid allikaid ülimalt väljenduvatest loodustest ja muudetud UTR teekidest; tõelise UTR muutmismeetod;
Koostöös spetsialistlike AI algoritmide meeskonnaga täiendada koodooni optimeerimist.
Lisa polyA-järjendid DNA-mallide järgi, et kontrollida mRNA pikkust täpsemalt.
Saavuta tõhus mRNA väljendamine madalaima immunogeensega.
Kahe raportööri mRNA järjestuse disain: mCherry-eGFP mRNA
Yaohai Bio-Pharma mRNA teenus jätkab arendamist kahe raportööri gene tandemjada disainimisega ja optimeerimisega, mis võimaldab kahe gene koos väljendamist.
Kasutades traditsioonilist transfeerimisreost, transfekteeritakse kahe gene tandemjada mCherry-eGFP mRNA 293T rakudesse ning tuvastatakse kaks fluoresentsignaali: mCherry (punane) ja tugevasti fluoreseeriv roheline prot eiine (eGFP), mis väljenduvad 48 tunni pärast samal ajal, ja liitmiskuju on esiletõstetud kollases.
MCherry-eGFP mRNA väljendamine 293T rakudes