Tsirkulaarset mRNA-d (circRNA) on laialdaselt kasutatud geenide või valkude funktsioonide uurimisel. Vahepeal on see populaarne profülaktiliste ja terapeutiliste bioloogiliste ravimite väljatöötamisel, sarnaselt mRNA-ga.
Yaohai Bio-Pharma on loonud kvaliteetse RNA pakkumiseks tsirkRNA sünteesitehnoloogiate komplekti, nagu järjestuste kujundamine ja optimeerimine, in vitro transkriptsioon (IVT), tsirkulariseerimine/tsüklistamine, puhastamine ja lipiidide nanoosakeste (LNP) kapseldamine. Kõik tooted vabastatakse rangete kvaliteedikontrolli (QC) standardite alusel.
Võrreldes lineaarse mRNA-ga on tsirkulaarne RNA (circRNA) struktuurilt stabiilsem ja see on praegustes nukleiinhapete ravimite uuringutes peamine kuum koht. Sellel on lai valik rakendusi erinevates valdkondades, kas kodeeriva tsirRNA või mittekodeeriva tsirRNA-na, sealhulgas nakkushaiguste profülaktilised vaktsiinid, terapeutilised onkoloogilised vaktsiinid, terapeutilised onkoloogilised ravimid, valgu asendusravi, regeneratiivne meditsiin, raku- ja geeniteraapia (CGT) , molekulaarse käsna roll ja RNA aptameer.
Protsess | Valikuline teenus | Teenuse üksikasjad | Tarneaeg (päev) |
circRNA järjestuse kujundamine ja optimeerimine | Kodeerimisjärjestuste kavandamine ja optimeerimine | CDS-i koodoni optimeerimine | 1 |
Mittekodeerivate järjestuste kujundamine ja optimeerimine | Introni ja eksoni järjestus, homoloogse käe ja vahetüki projekteerimine ja optimeerimine | 1-2 | |
Ringikujulise plasmiidi valmistamine | Geenide süntees | Geeni süntees (kolmanda osapoole) | 7-10 |
Plasmiidi võimendamine | Plasmiidi võimendamine | 2 | |
Plasmiidi ekstraheerimine | |||
Lineariseeritud plasmiidi valmistamine | Plasmiidi lineariseerimine ja puhastamine | Plasmiidi lineariseerimine | 1 |
Lineariseerimine DNA puhastamine | |||
In vitro transkriptsioon ja tsüklistamine | In vitro transkriptsioon ja tsüklistamine | In vitro transkriptsiooni- ja tsüklistamisreaktsioonid | 1-2 |
RNaasi R seedimine | |||
Optimeerimine - valikuline | Reaktsiooni koostis, aja optimeerimine | 2-5 | |
tsirkRNA puhastamine | Tavaline puhastusmeetod | Liitiumkloriidi sade | 1 |
Magnethelmeste puhastamine | 1 | ||
Väga puhas tsirkRNA puhastamine | Ettevalmistav kõrgjõudlusega vedelikkromatograafia (HPLC) | 1-2 | |
Puhvrivahetus | Ultrafiltratsioon | 1 | |
tsirkRNA lüofiliseerimine | Proovi täitmine | Täitmine | 2-3 |
Lüofiliseerimine | Eelkülmutamine | ||
Esmane kuivatamine (sublimatsioon) | |||
Sekundaarne kuivatamine (desorptsioon) | |||
tsircRNA-LNP kapseldamine | LNP kapseldus | Materjalide ja vedelike eeltöötlus | 2 |
Mikrofluidse seadme segamine | |||
Puhvrivahetus | Tangentsiaalse voolu filtreerimine | 1 | |
Steriliseerige | Filtreerimine | ||
Plasmiidse DNA kvaliteedikontroll | Kontsentratsioon/puhtus | Ultraviolett (UV) spektrofotomeetria | 1-2 |
Plasmiidi konformatsioon | Agaroosgeeli elektroforees (AGE) | ||
Kapillaarelektroforees (CE) – valikuline | |||
Plasmiid tuvastada | Restriktsiooniensüümide identifitseerimine/vanus | ||
CircRNA kvaliteedikontroll | Kontsentratsioon/puhtus | Ultraviolett (UV) spektrofotomeetria | - |
Puhtus | Agaroosgeeli elektroforees (AGE)/E-geel | 0.5 | |
HPLC-valikuline | 1 | ||
CircRNA-LNP kvaliteedikontroll | Kapseldamise efektiivsus | RiboGreeni meetod | 1 |
Osakese suurus | Dünaamiline valguse hajumine (DLS) | 1 | |
Polüdisperssuse indeks | Dünaamiline valguse hajumine (DLS) | 1 | |
Zeta potentsiaal | Dünaamiline valguse hajumine (DLS) | 1 | |
Rakupõhine potentsianalüüs | Rakkude transfektsioon | Rakkude plaadistamine, rakkude transfektsioon | 4 |
Sihtvalgu tuvastamine | Fluorestsentsvaatlus, Western Blot/ELISA | 1-3 |
Transfekteerisime täiustatud rohelise fluorestseeruva valgu tsirRNA (eGFP tsirRNA), mCherry circRNA, lutsiferaasi tsirRNA 293T rakkudesse ja tuvastasime sihtvalgu fluorestsentsi, luminestsents- või värvisignaali, Western blot (WB), ensüümiga seotud immunosorbentanalüüsi (ELISA) abil.
Yaohai Bio-Pharma tsirkRNA proovide rakupõhised tugevusanalüüsid