Yaohai Bio-Pharma は、PIE システム (エクソンとイントロンのアライメント) に基づいて circRNA を製造します。PIE システムでは、I 型イントロンの自己スプライシング機能を利用して RNA の環化を実現します。PIE 構造は、T4 td 遺伝子または fishy tRNA 前駆体遺伝子を使用して設計され、配置は次のとおりです。
RNAイントロンとそれを支えるエクソン断片は5つの部分(3'末端と5'末端)に分割され、3'末端配列は標的配列の末尾に転送され、XNUMX'末端配列は標的配列の先頭に挿入され、標的遺伝子配列は中間に挿入されます。
PIE 構造は、GTP の触媒作用により、イントロン以外の配列の環化を引き起こします。合理的な環化率向上戦略と組み合わせることで、Yaohai Bio-Pharma は 4 kb までの配列の環化を 80% を超える環化率で達成できます。
図1. PIEシステムに基づくcircRNAのin vitro循環
プロセス | オプションサービス | サービスの詳細 | 配達期間(営業日) |
circRNA配列設計と最適化 | コード配列の設計と最適化 |
CDS配列アライメント CDSコドン最適化 |
1 |
非コード配列の設計と最適化 |
イントロンとエクソンの配列設計と最適化 相同アーム配列の設計と最適化 スペーサー配列の設計と最適化 |
1-2 |
CircRNA コンポーネント | 生体機能 | 最適化戦略 | |
2つの末端イントロンとエクソン配列 | イントロンの外側の配列を環化するための GTP 触媒イントロン自己スプライシング。 | T4 td 遺伝子または魚油 tRNA 前駆体遺伝子に基づいて設計されています。 | |
コーディング | IRES | circRNA の翻訳を制御する内部リボソーム認識部位。 | EMCV、CVB3 ソースなど、さまざまなウイルス ソースからの内部リボソーム エントリ サイト (IRES) 配列のスクリーニング。 |
CDS | タンパク質コード領域、抗原、抗体、またはその他の機能性タンパク質をコードする配列。 | コドンの最適化により翻訳レベルが向上します。特定の非最適コドンはタンパク質の折り畳みに役割を果たす可能性があります。 | |
非コーディング | 非コード配列 | miRNA またはタンパク質をターゲットにして、遺伝子またはタンパク質の調節を実行します。 | miRNA またはタンパク質の特定の結合部位をターゲットにすると、結合部位の配列を繰り返すことができます。 |
Yaohai Bio-Pharma は、PIE システムに基づいて RNA の環化を実現するコントロール製品である強化緑色蛍光タンパク質 (eGFP) circRNA を発売しました。
従来のトランスフェクション試薬を使用して、eGFP circRNA を 293T 細胞にトランスフェクトすると、24 時間後に eGFP (緑) 蛍光シグナルが検出され、48 時間後には増強されます。トランスフェクション後 7 日目と 14 日目にも蛍光シグナルが検出されます。
eGFP circRNAのin vitro発現検証